甲状腺穿刺即细针穿刺细胞学检查（FNAC）是确定甲状腺结节良恶性的重要手段，通过细胞形态学观察，良性细胞形态规则，恶性细胞有明显异型性等，还结合Bethesda分类系统，I类标本无法诊断等，不同类对应不同恶性风险，临床决策综合患者整体情况，有既往病史者对比既往结果参考。
细胞形态学观察
良性表现：如果穿刺样本中细胞形态较为规则，如滤泡上皮细胞呈正常的滤泡样排列，细胞无异型性，没有核分裂象等。例如，常见的胶质细胞丰富，滤泡上皮细胞呈单层排列，形态与正常甲状腺滤泡上皮细胞相似，这种情况多提示良性可能。
恶性表现：恶性细胞通常有明显的异型性，如细胞核增大、核质比增加、核形状不规则（可呈瓜子形、不规则形等）、可见病理性核分裂象等。比如甲状腺乳头状癌的穿刺细胞可呈现特征性的毛玻璃样核等表现；甲状腺滤泡癌则可能看到滤泡结构，但细胞有异型性，且可能侵犯包膜等。
结合Bethesda分类系统
I类：标本无法诊断或不满意，需要重新穿刺获取足够标本。
II类：良性病变，恶性风险＜5%。通常细胞形态符合良性特征，如上述的正常滤泡样结构等情况。
III类：意义不明确的细胞异常，恶性风险5%-15%。细胞有一定的不典型性，但还不足以诊断为恶性或良性，需要密切随访或进一步检查。
IV类：可疑恶性，恶性风险15%-75%。细胞异型性较明显，但还没有达到典型的恶性细胞表现，但高度怀疑恶性可能。
V类：高度可疑恶性，恶性风险＞75%。细胞形态符合典型的恶性特征，高度提示为恶性肿瘤。
VI类：已活检证实的恶性肿瘤。
对于不同年龄、性别等人群，甲状腺穿刺结果确定良恶性的基本判断依据是相同的细胞形态学及分类系统，但在临床决策时会综合考虑患者的整体情况。例如，儿童甲状腺结节相对恶性概率较低，但仍需依据穿刺结果准确判断；女性患者甲状腺疾病的发生可能与激素水平等有一定关系，但穿刺结果判断良恶性主要还是基于细胞本身的形态等特征。对于有既往甲状腺疾病史的患者，对比既往穿刺或检查结果来判断此次穿刺结果的良恶性变化也是重要的参考。
