亚急性甲状腺炎有全身症状，如起病前1-3周有上呼吸道感染病史致发热等，不同年龄、性别、健康状况者表现有别；有甲状腺局部症状，包括疼痛（可放射且程度不一）、肿大（弥漫或对称等，不同年龄、性别表现有差异）及功能异常相关表现（早期甲亢、后期甲减，不同年龄、性别影响不同）；部分患者伴颈部淋巴结肿大，不同生活方式及自身免疫病病史者伴随症状有差异。
甲状腺局部症状
甲状腺疼痛与肿大：甲状腺部位疼痛是常见症状，疼痛可呈放射性，常放射至耳部、下颌等部位，疼痛程度不一，有的患者为隐痛，有的则较为剧烈。甲状腺会出现不同程度的肿大，多为双侧甲状腺弥漫性或对称性肿大，也可单侧肿大，肿大的甲状腺质地较硬，触痛明显，这是由于炎症累及甲状腺组织，导致甲状腺组织充血、水肿，引发疼痛和肿大，年龄较小的患者甲状腺肿大可能相对更易被忽视，因为儿童表述可能不清晰，而老年患者可能同时合并其他疾病，甲状腺肿大表现可能与基础疾病相互影响；女性患者在月经周期等生理变化时，甲状腺局部症状可能会有一定波动，比如月经前可能疼痛稍有加重等情况。
甲状腺功能异常相关表现：疾病早期由于甲状腺滤泡被破坏，甲状腺激素释放进入血液，可出现甲亢症状，如心悸、手抖、多汗、消瘦等，这是因为甲状腺激素释放入血导致机体代谢亢进；随着病情进展，甲状腺激素消耗殆尽，可能出现甲减症状，如畏寒、乏力、水肿、反应迟钝等。不同年龄患者甲状腺功能异常表现有所不同，儿童患者甲亢时可能影响生长发育，出现生长速度减慢等情况，成人则主要表现为机体代谢和各系统功能的改变，男性患者甲状腺功能异常时可能影响生殖系统等功能，女性患者可能影响月经周期等。
其他伴随症状
部分患者可能伴有颈部淋巴结肿大，这是因为甲状腺炎症通过淋巴系统引发周围淋巴结反应性增生，一般肿大的淋巴结质地中等，可有轻度压痛。不同生活方式的人群，如长期精神压力大的患者可能伴随症状相对更明显，有自身免疫性疾病病史的患者出现亚急性甲状腺炎时，伴随症状可能与基础疾病相互关联，比如本身有类风湿关节炎的患者，可能全身症状更复杂等情况。
