亚急性甲状腺炎有全身症状和甲状腺局部症状，全身症状多在起病前1-3周有病毒性上呼吸道感染病史，起病急，有全身不适等表现；甲状腺局部有疼痛与肿大，且有甲亢期、甲减期、恢复期不同甲状腺功能异常相关表现，儿童、老年、妊娠期等特殊人群表现有差异，部分患者可能遗留永久性甲减需长期随访。
甲状腺局部症状
甲状腺疼痛与肿大
甲状腺区疼痛是亚急性甲状腺炎的典型症状之一，疼痛可放射至耳部，吞咽时疼痛加重。甲状腺多呈轻至中度肿大，可单侧或双侧受累，质地较硬。在儿童亚急性甲状腺炎中，甲状腺肿大可能相对更难被察觉，但仔细检查可发现甲状腺体积较正常增大。
甲状腺肿大的程度和疼痛程度个体差异较大，部分患者甲状腺肿大较为显著，而疼痛相对较轻；反之亦然。对于有既往甲状腺疾病病史的患者，亚急性甲状腺炎发作时甲状腺局部症状可能会有所不同，例如既往有甲状腺炎病史的患者，此次发病时甲状腺疼痛和肿大的特点可能与首次发病有所差异。
甲状腺功能异常相关表现
甲亢期：由于甲状腺滤泡被炎症破坏，甲状腺激素释放入血，患者可出现甲亢症状，如心悸、手抖、多汗、体重减轻等。此时血清甲状腺激素水平升高，促甲状腺激素（TSH）水平降低。在老年患者中，甲亢表现可能不典型，容易被忽视，可能仅表现为心慌、乏力等非特异性症状，需要医生结合甲状腺功能检查等进行综合判断；儿童患者出现甲亢表现时，可能会影响生长发育，因为甲状腺激素对儿童生长发育尤其是神经系统和骨骼发育至关重要，所以需要及时关注和干预。
甲减期：随着疾病进展，甲状腺滤泡细胞破坏严重，甲状腺激素合成减少，部分患者可出现甲减症状，如畏寒、乏力、水肿、便秘等。此时血清甲状腺激素水平降低，TSH水平升高。对于妊娠期女性患者，甲减期可能会对胎儿的神经系统发育产生不良影响，因为胎儿的甲状腺激素依赖于母体供应，所以妊娠期亚急性甲状腺炎患者在甲减期需要密切监测甲状腺功能，并根据情况进行适当的甲状腺激素替代治疗。
恢复期：多数患者甲状腺功能可恢复正常，症状逐渐缓解。但也有少数患者可能会遗留永久性甲状腺功能减退，需要长期随访甲状腺功能。
