肝囊肿症状分无症状和有症状表现，无症状者多在体检偶然发现；有症状表现包括压迫相关（压迫胃肠道致饱胀、食欲减退，压迫胆管致黄疸，压迫血管较少见）、疼痛相关（上腹部或右上腹隐痛、胀痛，合并感染有发热）及少见的破裂出血致剧烈腹痛、休克前期症状。
许多肝囊肿较小的患者通常没有明显症状。这是因为囊肿体积小时，对肝脏周围组织的压迫及对肝脏功能的影响非常轻微，所以身体不会出现不适感觉。对于这类人群，多是在体检做超声等检查时偶然发现肝囊肿。例如，一些因其他疾病进行腹部超声检查的患者，意外发现肝脏有较小的囊肿，但自身并无任何异常感觉。
有症状表现
压迫相关症状：
压迫胃肠道：当肝囊肿较大时，可能会压迫胃肠道，导致患者出现饱胀感、食欲减退等症状。这是因为囊肿占据了腹腔内一定空间，挤压胃肠道，影响胃肠道的正常蠕动和消化功能。比如，一位肝囊肿较大的患者可能会感觉吃饭后很快就有饱腹感，不想进食。对于儿童来说，若肝囊肿较大压迫胃肠道，可能会影响其正常的生长发育，因为营养摄入受到影响。
压迫胆管：肝囊肿压迫胆管时，可能引起黄疸，表现为皮肤和巩膜发黄，尿液颜色加深等。这是由于胆管受压后，胆汁排泄受阻，胆红素逆流入血导致。对于老年人，肝囊肿压迫胆管引起黄疸时，身体代谢和各器官功能相对较弱，黄疸可能会对其肝、肾等多器官功能产生进一步影响，需要更密切观察和处理。
压迫血管：较大的肝囊肿压迫肝内血管，可能影响血液循环，不过这种情况相对较少见。但一旦发生，可能会对肝脏局部的血流供应产生影响，进而影响肝脏的正常功能。
疼痛相关症状：部分患者可能会感到上腹部或右上腹隐痛、胀痛等。疼痛的原因可能是囊肿增大牵拉肝包膜，或者合并感染、出血等情况。如果肝囊肿合并感染，除了疼痛加剧外，还可能伴有发热等症状。对于女性患者，在生理期等特殊时期，身体状态有所变化，肝囊肿引起的疼痛可能会有不同表现，需要注意与生理期其他不适相鉴别。儿童如果肝囊肿出现疼痛，由于表达能力有限，可能会表现出哭闹等异常行为，家长需要密切关注。
其他少见症状：极少数情况下，肝囊肿可能发生破裂、出血等情况，此时患者会突然出现剧烈腹痛，伴有面色苍白、心率加快等休克表现的前期症状。这种情况较为危急，需要立即就医处理。
