胃肠型感冒由病毒感染引起，有胃肠及感冒全身症状，血常规等检查有相应表现，病程自限；急性胃肠炎多因饮食致细菌等感染，以胃肠症状为主，血常规等检查有相应特征，病程依情况而定，二者在病因、症状、检查、病程预后方面均有不同。
急性胃肠炎：多由饮食因素导致，如食用被细菌（如大肠杆菌、沙门氏菌等）、毒素污染的食物，或摄入过于刺激性、变质的食物等，各年龄、性别人群均可发病，有不洁饮食史人群发病风险较高，本身有胃肠道基础疾病者发病后可能症状更重。
症状表现方面
胃肠型感冒：除了有胃肠道症状，如恶心、呕吐、腹痛、腹泻等，还常伴有感冒的全身症状，像发热、头痛、鼻塞、流涕、咳嗽等，发热程度可因个体差异有所不同，一般体温在38℃左右或更高，全身症状相对较明显，胃肠道症状相对感冒症状可能稍轻。不同年龄人群症状表现可能有一定差异，儿童可能在胃肠道症状基础上更容易出现精神不佳等情况。
急性胃肠炎：主要以胃肠道症状为主，恶心、呕吐较为突出，呕吐物多为胃内容物，腹泻频繁，大便多为稀水样或黏液便，一般无明显的全身感冒症状，发热相对少见或体温一般不高，若有发热多是由细菌感染等引起的炎症反应导致，胃肠道局部症状更重。
实验室检查方面
胃肠型感冒：血常规检查可见白细胞计数正常或偏低，淋巴细胞比例可能升高，病毒特异性抗体检测可发现相应病毒感染的证据，如柯萨奇病毒抗体等。不同年龄患者的血常规等指标可能因身体发育等因素有一定波动，儿童的免疫指标变化可能相对更为敏感。
急性胃肠炎：血常规检查若为细菌感染引起，白细胞计数和中性粒细胞比例常升高，大便常规检查可见白细胞、脓细胞等，粪便细菌培养可找到相应致病细菌，根据不同致病因素检查结果有相应特征，有基础疾病的患者检查结果可能受基础疾病影响而表现不典型。
病程预后方面
胃肠型感冒：病程一般具有自限性，通常一周左右可逐渐恢复，经过适当休息、对症处理后大多能痊愈，儿童患者恢复时间可能相对成人稍快或稍慢，与自身免疫力等有关，有慢性疾病的患者可能恢复时间延长。
急性胃肠炎：病程取决于病情严重程度和治疗情况，一般经过规范的饮食调整、对症治疗后，轻者数天可好转，重者可能需要一周左右甚至更长时间，儿童患者由于胃肠道功能相对较弱，病情变化较快，需密切关注脱水等并发症情况，有基础疾病者恢复时间可能延长且易复发。
