新生儿乳糖不耐受有消化系统和其他伴随等症状，消化系统症状主要有腹泻（大便次数多、呈特定性状）、腹胀（肠道气体积聚致腹部膨隆）；其他伴随症状包括肠痉挛（突然哭闹难安抚）、少数有呕吐（反射性吐出未消化奶液），早产儿等特殊群体相关症状可能更明显或发生率更高。
一、消化系统症状
1.腹泻
新生儿乳糖不耐受最常见的消化系统症状是腹泻。通常大便次数较多，每日可达数次至十数次不等。大便多为黄色或青绿色稀糊便，或呈蛋花汤样，泡沫较多，有酸臭味。这是因为乳糖不能被新生儿肠道正常消化吸收，在肠道内被细菌分解发酵，导致肠道渗透压增高，水分吸收减少，从而引起腹泻。例如，相关研究表明，约70%的乳糖不耐受新生儿会出现每日数次的腹泻症状，且粪便中乳糖含量较高。
对于母乳喂养的新生儿，若母亲摄入含乳糖的食物后，新生儿腹泻可能会更明显，因为母乳中含有乳糖，新生儿无法消化导致肠道内乳糖积聚，加重腹泻。
2.腹胀
新生儿可能会出现腹胀的情况。由于肠道内气体产生增多，气体在肠道内积聚，导致腹部膨隆。腹胀可能会使新生儿感到不适，表现为哭闹不安等。这是因为乳糖在肠道内被细菌发酵产生大量气体，如氢气、二氧化碳等，气体积聚在肠道内引起腹胀。一般来说，腹胀程度可轻可重，严重时可能影响新生儿的进食和呼吸。
二、其他伴随症状
1.肠痉挛
部分新生儿可能会出现肠痉挛，表现为突然性的哭闹，可持续较长时间，难以安抚。这是因为乳糖不耐受引起肠道功能紊乱，肠道蠕动异常，导致肠痉挛发作。例如，有研究发现，约30%-40%的乳糖不耐受新生儿会出现不同程度的肠痉挛现象，哭闹时腹部可能会有紧张感。
对于早产儿等特殊新生儿群体，由于其肠道发育相对更不完善，乳糖不耐受时发生肠痉挛的概率可能更高，且症状可能更明显，需要特别关注，因为肠痉挛可能会影响新生儿的营养摄入和生长发育。
2.呕吐
少数新生儿可能会出现呕吐症状。呕吐物多为未消化的奶液，可能是因为肠道不适引起的反射性呕吐。当新生儿乳糖不耐受导致肠道功能紊乱时，胃肠道的正常蠕动和消化功能受到影响，奶液不能顺利通过肠道，从而引起呕吐。不过，呕吐在乳糖不耐受新生儿中的发生率相对腹泻、腹胀等症状较低，但也需要引起重视。
对于有早产史、低出生体重等病史的新生儿，出现呕吐时更要警惕是否与乳糖不耐受相关，因为这类新生儿本身肠道功能更脆弱，乳糖不耐受可能会加重肠道负担，导致呕吐等症状加重。
