乳糖不耐受的宝宝会出现多种症状，消化系统方面有腹泻（大便次数多、稀糊或蛋花汤样等）、腹胀（腹部膨隆，进食含乳糖食物后加重）；胃肠道不适有肠痉挛（阵发性哭闹）、呕吐（相对少见）；还会影响生长发育，粪便有酸臭味。
一、消化系统症状
1.腹泻
对于婴儿乳糖不耐受，腹泻是常见且典型的症状。通常大便次数较多，每日可达数次至十数次不等，大便多为黄色或青绿色稀糊便，或呈蛋花汤样，泡沫较多，有奶块，少数患儿有奶瓣。这是因为乳糖不耐受时，乳糖不能被充分消化吸收，在肠道内被肠道细菌发酵分解，产生气体，导致肠道蠕动加快，从而引起腹泻。例如有研究表明，乳糖不耐受患儿中约80%会出现腹泻症状，且粪便中乳糖含量较高。
对于年龄稍大的宝宝，也可能出现大便次数增多的情况，质地偏稀，可能伴有未消化的食物残渣等。
2.腹胀
宝宝可能会出现腹部膨隆的表现，这是由于肠道内未消化的乳糖被细菌发酵产生气体，导致肠道内气体积聚，引起腹胀。宝宝可能会表现出不安、哭闹等情况，尤其是在进食含乳糖食物后，腹胀可能会加重。例如一些临床观察发现，约60%的乳糖不耐受宝宝会出现不同程度的腹胀症状。
二、胃肠道不适相关表现
1.肠痉挛
宝宝可能会出现阵发性的哭闹，难以安抚。这是因为肠道内气体积聚等原因刺激肠道，引起肠痉挛。乳糖不耐受导致肠道内环境改变，刺激肠道神经，引发肠痉挛，使宝宝感到腹部疼痛不适，从而通过哭闹来表达。有研究显示，约40%的乳糖不耐受宝宝会出现肠痉挛相关表现。
2.呕吐
部分宝宝可能会出现呕吐症状，尤其是在进食较多含乳糖食物后。呕吐物多为胃内容物，这是由于胃肠道受到乳糖不耐受的影响，出现功能紊乱，导致呕吐发生。不过呕吐在乳糖不耐受宝宝中的发生率相对腹泻、腹胀等症状稍低，约占20%-30%左右。
三、其他相关表现
1.生长发育影响
对于长期乳糖不耐受的宝宝，可能会影响生长发育。因为乳糖是宝宝生长发育过程中重要的营养来源之一，长期乳糖不耐受会导致宝宝不能充分获取乳糖中的能量等营养成分，从而影响体重增长、身高增长等。例如一些研究追踪发现，乳糖不耐受未得到有效处理的宝宝，其体重增长速度可能低于正常宝宝，身高增长也可能相对缓慢。
2.粪便气味
乳糖不耐受宝宝的粪便可能会有酸臭味。这是因为肠道内未消化的乳糖被细菌发酵，产生酸性物质，导致粪便气味改变。通过观察粪便气味也可以作为判断宝宝是否乳糖不耐受的一个辅助依据，但需要结合其他症状综合判断。
