肝肿瘤的诊断需进行病史采集、体格检查、实验室检查、影像学检查及病理检查。病史采集了解一般情况与症状表现；体格检查查肝脏等情况；实验室检查包括肿瘤标志物及肝炎病毒检测；影像学检查有超声、CT、MRI等；病理检查靠穿刺活检，是确诊金标准且有风险需严格掌握适应证。
症状表现：询问患者有无肝区疼痛，肝肿瘤患者可能出现右上腹或肝区的隐痛、胀痛等；有无乏力、消瘦、食欲减退等全身及消化道症状，肿瘤消耗等因素可导致患者出现这些非特异性表现；有无黄疸，若肿瘤压迫胆管等可能引起黄疸，表现为皮肤巩膜黄染等。
体格检查
肝脏情况：检查肝脏大小、质地等，肝癌患者肝脏可能肿大，质地坚硬；有无肝区压痛等。
其他体征：观察有无黄疸、腹水征等，若有腹水可能提示肿瘤晚期等情况。
实验室检查
肿瘤标志物检测：
甲胎蛋白（AFP）：AFP是诊断肝癌的重要指标，血清AFP＞400μg/L，排除妊娠、生殖腺胚胎瘤等情况，应高度怀疑肝癌；虽然AFP对肝癌诊断有重要价值，但约30%的肝癌患者AFP不升高。
其他标志物：如异常凝血酶原（PIVKA-Ⅱ）、高尔基体蛋白73（GP73）等，在肝癌诊断中也有一定辅助价值。
肝炎病毒检测：检测HBVDNA、HCVRNA等，明确患者是否存在肝炎病毒感染及病毒复制情况，这对于评估肝肿瘤的病因及后续治疗等有重要意义。
影像学检查
超声检查：
常规超声：是肝肿瘤筛查的常用方法，可初步发现肝脏占位性病变，能显示肿瘤的大小、形态、部位等，还可观察有无门静脉、肝静脉癌栓等。但对于一些小的、等回声的肿瘤可能存在漏诊情况。
超声造影：能增强病变与周围组织的对比，提高小肝癌的检出率，有助于鉴别肿瘤的良恶性。
计算机断层扫描（CT）：
平扫+增强CT：是诊断肝肿瘤的重要手段，可清晰显示肿瘤的形态、大小、数目及与周围血管的关系等。动脉期肿瘤多呈明显强化，门静脉期或平衡期强化消退，呈“快进快出”的强化特点，有助于肝癌的诊断；对于肝血管瘤等疾病，也有其典型的强化表现，可进行鉴别。
磁共振成像（MRI）：
平扫+增强MRI：对肝肿瘤的诊断价值与CT相似，且在显示肿瘤内部结构、有无子灶及与血管的关系等方面可能优于CT，特别是对一些小的肝肿瘤、血管瘤等的鉴别诊断更具优势，例如肝细胞癌在MRI上T2加权像多呈稍高信号，且弥散加权成像（DWI）多呈高信号等。
病理检查
穿刺活检：对于通过影像学等检查仍难以明确性质的肝占位病变，可考虑在超声或CT引导下进行穿刺活检，获取病变组织进行病理检查，以明确肿瘤的病理类型等，这是确诊肝肿瘤的金标准。但穿刺活检有一定的出血、种植转移等风险，需严格掌握适应证。
