胃肠息肉形成受遗传因素、炎症刺激、生活方式因素和年龄因素影响。遗传方面家族性腺瘤性息肉病等与基因有关；炎症刺激如长期胃肠炎症易致息肉；生活方式中饮食、吸烟酗酒等有影响；年龄增长一般使风险增加，近年青年儿童发生率也上升。
炎症刺激
长期的胃肠道炎症是胃肠息肉形成的重要因素之一。例如慢性胃炎患者，胃黏膜在慢性炎症的持续刺激下，上皮细胞会异常增生，逐渐形成息肉；慢性结肠炎患者，肠道黏膜反复受到炎症因子的影响，也会导致肠黏膜上皮和腺体的异常增殖，进而引发结肠息肉。不同年龄阶段都可能发生炎症，但对于儿童来说，感染性肠炎如果未能得到有效控制，也可能增加胃肠息肉发生的潜在风险；女性在生理期前后或孕期，由于身体内分泌等变化，可能会使原本存在的胃肠道炎症加重，从而促进息肉形成；有长期不良生活方式如吸烟、酗酒的人群，其胃肠道更容易受到炎症侵害，进而增加息肉形成几率；有胃肠道病史的人群，如曾经患过严重胃溃疡、反复结肠炎等，发生胃肠息肉的可能性较无病史人群更高。
生活方式因素
饮食：长期高动物脂肪、低纤维饮食是胃肠息肉形成的危险因素。比如长期大量摄入红肉（牛肉、羊肉、猪肉等），同时蔬菜、水果摄入不足的人群，胃肠道内的环境不利于肠道正常蠕动和代谢，容易导致肠道黏膜异常增殖形成息肉。儿童如果长期饮食不均衡，偏爱油炸、高糖等不健康食物，也可能影响胃肠道健康，增加息肉风险；女性在饮食方面如果不注意调整，同样可能因为饮食结构不合理而促进息肉形成；吸烟者烟草中的有害物质会影响胃肠道的正常生理功能，酗酒者酒精会刺激胃肠道黏膜，这些不良生活方式都会干扰胃肠道的正常代谢，使得胃肠息肉形成的概率上升；有胃肠道疾病病史的人群，本身胃肠道功能就相对较弱，不合理的饮食会进一步加重胃肠道负担，促进息肉生成。
吸烟与酗酒：吸烟时产生的尼古丁等有害物质会损害胃肠道黏膜的屏障功能，影响黏膜的修复和正常代谢，增加息肉形成的可能性；过量饮酒会直接刺激胃黏膜和肠黏膜，引起黏膜充血、水肿等炎症反应，长期如此就容易诱发息肉。
年龄因素
随着年龄的增长，胃肠黏膜的功能逐渐下降，细胞的修复和更新能力减弱，发生异常增殖形成息肉的几率也会增加。一般中老年人胃肠息肉的发生率相对较高，但近年来由于饮食和生活方式等因素的影响，青年甚至儿童胃肠息肉的发生率也有上升趋势，不过总体而言，年龄越大相对风险越高。儿童时期如果存在一些先天发育问题或后天不良因素影响，也可能较早出现胃肠息肉；女性在不同年龄段，如更年期前后，由于激素水平变化等因素，胃肠息肉的发生情况也会有所不同；有长期吸烟酗酒等不良生活方式的中老年人，胃肠息肉形成的速度可能会比生活方式健康的同龄人更快；有胃肠道疾病病史的老年人，胃肠黏膜已经处于相对脆弱的状态，年龄增长会进一步加重黏膜的损伤和异常增殖，使得息肉更容易形成。
