非寄生虫性肝囊肿病因复杂，包括先天性因素（肝内胆管、淋巴管发育异常）和后天性因素（创伤、炎症、代谢因素等），先天性因素在胚胎期就存在，后天性因素中创伤、炎症、代谢因素等各有其影响，部分有家族遗传倾向，不同情况在年龄、性别等方面有不同表现。
先天性因素：
肝内胆管发育异常：在胚胎发育时期，肝内胆管的发育出现异常，导致胆管的局部扩张形成囊肿。这种情况在胚胎早期就已存在，随着年龄增长可能逐渐被发现。例如，部分先天性肝囊肿患者在儿童时期可能就有微小的囊肿形成，但由于体积小未引起明显症状，随着年龄增加，囊肿可能逐渐增大。对于女性和男性在先天性因素方面并没有明显的性别差异，而不同生活方式对先天性肝囊肿的发生影响不大，但有家族遗传倾向的人群，其后代发生非寄生虫性肝囊肿的风险可能相对较高，有家族史的人群需要更密切关注肝脏情况。
淋巴管发育异常：胚胎时期淋巴管发育异常也可能导致肝囊肿的形成。淋巴管的异常扩张、迂曲等情况，使得淋巴液在局部聚集形成囊肿。这种先天性的淋巴管发育问题是导致非寄生虫性肝囊肿的一个重要先天性因素来源。
后天性因素：
创伤：肝脏受到外伤后，局部组织出现血肿，血肿机化后可能形成囊肿。比如腹部受到撞击等外伤后，肝脏局部组织受损，修复过程中可能出现局部的囊性变。对于有肝脏创伤病史的人群，发生非寄生虫性肝囊肿的风险可能会增加，尤其是有反复肝脏创伤的患者。在生活方式方面，从事高风险职业（如经常参与剧烈对抗性运动、建筑工人等）的人群，肝脏受到创伤的几率较高，相对更容易出现后天性因素导致的非寄生虫性肝囊肿。
炎症：肝脏的慢性炎症可能导致肝内的小胆管阻塞，胆汁潴留形成囊肿。例如慢性乙型肝炎、丙型肝炎等肝脏炎症性疾病，长期的炎症刺激会影响胆管的正常引流，进而促使囊肿形成。对于患有慢性肝脏炎症的患者，需要积极治疗基础疾病，以降低非寄生虫性肝囊肿的发生风险。不同年龄阶段的患者，肝脏炎症的发生原因可能有所不同，儿童时期的肝脏炎症可能多与病毒性肝炎（如乙肝病毒、丙肝病毒感染）有关，而成年人的肝脏炎症可能还与自身免疫性肝炎、药物性肝损伤等多种因素相关。女性在一些自身免疫性肝脏疾病的发病几率上可能与男性有差异，需要特别关注自身免疫性因素对肝脏炎症的影响。
代谢因素：某些代谢性疾病可能与非寄生虫性肝囊肿的形成有关。例如，多囊肝-多囊肾综合征患者，除了肾脏出现多囊改变外，肝脏也会出现多个囊肿。这是由于体内的代谢调节异常，导致肝脏组织中出现多个囊性病变。对于患有多囊肝-多囊肾综合征的患者，需要定期监测肝脏和肾脏的情况，因为该疾病具有一定的遗传倾向，家族中有此类患者的人群需要进行基因筛查等相关检查，以便早期发现和干预。不同年龄的患者在代谢因素导致的非寄生虫性肝囊肿方面，发病表现可能有所不同，儿童时期发病可能更多与遗传代谢因素相关，而成年人发病可能与后天的代谢紊乱等因素有关。
