骨折不愈合的原因包括局部因素和全身因素。局部因素有感染破坏血运、血运破坏（骨折端血供不佳、软组织嵌入）、骨折端不稳定；全身因素有年龄（儿童相对强，老人慢）、健康状况（糖尿病影响、营养不良影响）、药物影响（长期用糖皮质激素等增加风险）。
感染：开放性骨折若处理不当，容易引发感染，感染会破坏骨折部位的血运，影响骨折愈合，例如严重的开放性骨折合并感染后，炎症会持续刺激骨折端，阻碍骨痂形成和骨折的修复过程。不同年龄段人群感染风险有所不同，儿童皮肤较娇嫩，开放性骨折后若护理不当更易感染；老年人本身机体抵抗力相对较弱，感染后也不利于骨折愈合。
血运破坏
骨折端血供不佳：如股骨颈骨折，尤其是头下型股骨颈骨折，骨折部位的血运破坏严重，股骨头的血液供应主要依靠旋股内、外侧动脉的分支，骨折后这些血管容易受损，导致股骨头缺血坏死，进而引起骨折不愈合。对于不同性别，在骨折发生时血运破坏的概率无明显性别差异，但不同部位骨折血运破坏对不同性别的影响可能因生理结构等因素有一定细微差别。生活方式中长期吸烟等不良习惯会影响血管功能，增加骨折端血运破坏后骨折不愈合的风险，有吸烟史的骨折患者需要特别注意改善生活方式以促进骨折愈合。
软组织嵌入：骨折时若有肌肉、肌腱等软组织嵌入骨折端之间，会阻碍骨折端的对合及愈合，比如某些复杂骨折中软组织嵌入情况较常见，会严重影响骨折的正常愈合进程。
骨折端不稳定：骨折固定不牢固会导致骨折端持续受到微动，这种微动不利于骨痂的形成和骨折的愈合，例如骨折后外固定装置松动等情况会造成骨折端不稳定。不同年龄阶段对骨折端不稳定的耐受程度不同，儿童骨折愈合能力相对较强，但长期的不稳定也会影响愈合；老年人骨折端本身血运等情况较差，不稳定会进一步加重愈合困难。
全身因素
年龄：儿童骨折愈合能力相对较强，但如果是严重的骨折或者伴有其他影响因素时也可能出现不愈合；老年人骨折后愈合速度较慢，因为老年人机体各项机能衰退，包括骨代谢能力下降等，所以更易发生骨折不愈合。例如老年人股骨粗隆间骨折，虽然愈合相对股骨颈骨折稍易，但仍比年轻人愈合慢且不愈合风险更高。
健康状况：患有糖尿病等基础疾病的患者，高血糖环境不利于骨折愈合，因为高血糖会影响细胞的功能和代谢，阻碍成骨细胞的活性等，从而增加骨折不愈合的几率。糖尿病患者骨折后需要严格控制血糖，以促进骨折愈合。患有营养不良的患者，由于缺乏蛋白质、维生素等营养物质，会影响骨组织的修复和重建，也容易出现骨折不愈合，比如缺乏维生素C会影响胶原合成，进而影响骨折愈合。
药物影响：长期使用某些药物可能影响骨折愈合，如糖皮质激素，它会抑制成骨细胞的活性，减少骨基质的合成等，从而导致骨折不愈合风险增加。但在临床使用糖皮质激素时需要权衡利弊，特殊人群如患有自身免疫性疾病等需要使用糖皮质激素的患者，在骨折后更要密切关注骨折愈合情况并采取相应措施促进愈合。
