甲状腺功能减退症状多样，涉及多系统。代谢率减低相关表现有全身乏力、体重增加、怕冷，儿童还影响生长智力，消化系统有食欲减退、腹胀便秘等；神经系统有记忆力减退、反应迟钝、嗜睡等，老年加重认知障碍，儿童智力停滞，还有手脚麻木、耳鸣听力下降等；心血管系统致心率减慢、心包积液，增冠心病风险；内分泌系统女性月经紊乱、影响受孕，男性性欲减退；皮肤毛发表现为干燥粗糙、黏液性水肿，头发干枯易脱、眉毛外1/3稀疏。
代谢率减低相关症状
全身表现：患者常感到全身乏力，这是因为甲状腺激素缺乏会使机体代谢活动减弱，能量产生减少。体重增加也是常见表现，由于代谢减慢，身体消耗的能量减少，多余的能量易转化为脂肪储存起来，但需注意与其他原因导致的体重增加相鉴别。部分患者会出现怕冷，相较于正常人更易感觉寒冷，这是因为甲状腺激素能促进机体产热，甲状腺功能减退时产热减少。
消化系统症状：胃肠道蠕动减慢，患者可能出现食欲减退，进食量较以往减少。还可能有腹胀、便秘等情况，严重时可能发生麻痹性肠梗阻。儿童患者若患甲状腺功能减退，还可能影响生长发育和智力发育，表现为生长迟缓、智力落后等，这是因为甲状腺激素对儿童的生长发育和神经系统发育至关重要，缺乏时会严重阻碍其正常进程。
神经系统症状
精神神经系统：患者常出现记忆力减退，尤其是近期记忆力下降较为明显。反应迟钝，对周围事物的反应速度变慢。严重时可能出现嗜睡，甚至昏迷，尤其是在病情严重且未得到有效控制时。对于老年患者，甲状腺功能减退可能会加重其已有的认知功能障碍，增加患痴呆的风险；而儿童患者则可能表现为智力发育停滞等。
感觉系统：部分患者会出现手脚麻木、刺痛等周围神经病变的表现。少数患者可能有耳鸣、听力下降等症状，这与甲状腺激素缺乏影响神经系统的正常功能有关，神经系统功能异常会波及到感觉器官相关的神经传导等。
心血管系统症状
心脏方面：甲状腺功能减退可导致心率减慢，严重时可能出现心包积液，这是因为甲状腺激素缺乏会影响心肌代谢和心脏的正常功能调节。长期未控制的甲状腺功能减退还可能增加冠心病的发生风险，因为代谢异常会影响心血管系统的正常状态，导致血管内皮功能受损等一系列改变。对于老年患者，本身心血管系统就存在一定的退行性变化，甲状腺功能减退可能会进一步加重心脏的负担，引发更严重的心血管并发症。
内分泌系统症状
女性患者：月经紊乱较为常见，可能出现月经量增多、经期延长等情况，严重时可能影响受孕，因为甲状腺功能减退会干扰女性的内分泌平衡，影响下丘脑-垂体-卵巢轴的正常功能，进而影响生殖系统的正常生理过程。
男性患者：可能出现性欲减退等表现，同样是由于甲状腺激素缺乏影响了内分泌系统的正常功能，导致性激素的分泌和调节出现异常。
皮肤及毛发症状
皮肤：皮肤干燥、粗糙，缺乏光泽，这是因为甲状腺激素缺乏会影响皮肤的新陈代谢，使皮肤的水分保持和角质层代谢等出现异常。严重时可能出现黏液性水肿，尤其在眼睑、下肢等部位较为明显，黏液性水肿是由于皮肤下的黏液蛋白沉积导致的。
毛发：头发变得干枯、易脱落，眉毛外1/3可能出现稀疏等情况，这与甲状腺激素对毛发的生长和代谢的影响有关，甲状腺激素缺乏会使毛发的生长周期紊乱，导致毛发质量下降。
