先兆流产的发生与遗传、母体、免疫、环境等多因素相关。遗传因素中约50%-60%先兆流产与胚胎染色体异常有关；母体因素包括内分泌异常（黄体功能不全、甲状腺功能异常等）、生殖器官异常（子宫畸形、宫腔粘连等）、全身性疾病（感染、严重贫血、慢性疾病等）；免疫因素有自身免疫异常和同种免疫异常；环境因素涉及化学物质接触和辐射暴露，这些因素均会影响胚胎发育或胎盘功能从而引发先兆流产。
母体因素
内分泌异常
黄体功能不全：黄体分泌的孕酮对维持妊娠至关重要。如果黄体功能不全，孕酮分泌不足，就不能为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，从而增加先兆流产的风险。研究表明，约30%-40%的先兆流产与黄体功能不全有关。例如，患有多囊卵巢综合征等内分泌疾病的女性，其黄体功能往往存在异常。
甲状腺功能异常：甲状腺分泌的甲状腺激素对胎儿的生长发育也起着重要作用。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会影响胚胎的发育；而甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也可能干扰妊娠过程，增加先兆流产的发生几率。有研究显示，甲状腺功能异常的孕妇先兆流产发生率高于甲状腺功能正常的孕妇。
生殖器官异常
子宫畸形：如先天性子宫纵隔、单角子宫等子宫畸形情况，会影响子宫腔的形态和内环境，使胚胎着床和发育受到限制，进而引发先兆流产。例如，子宫纵隔会占据宫腔空间，影响胚胎的正常着床和生长。
宫腔粘连：既往有宫腔操作史（如人工流产、清宫术等）可能导致宫腔粘连，宫腔粘连会使子宫内膜面积减少，影响胚胎的种植和发育，增加先兆流产的风险。
全身性疾病
感染：孕妇感染某些病原体，如弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等，可通过胎盘感染胚胎，引起胚胎发育异常，导致先兆流产。例如，孕妇感染风疹病毒，在妊娠早期可导致胚胎白内障、心脏畸形、耳聋等多种畸形，同时增加先兆流产的发生风险。
严重贫血：孕妇严重贫血时，身体各器官包括胎盘在内的血液供应不足，胎儿得不到充足的氧气和营养物质供应，影响胚胎发育，容易引发先兆流产。一般血红蛋白低于一定水平（如低于70g/L）时，先兆流产的风险会明显增加。
慢性疾病：如高血压、糖尿病等慢性疾病，如果控制不佳，也会影响胎盘的血流灌注和胎儿的生长发育，增加先兆流产的发生几率。例如，妊娠期高血压疾病会导致胎盘血管痉挛，影响胎盘功能，从而引发先兆流产。
免疫因素
自身免疫异常：孕妇自身存在抗磷脂抗体综合征等自身免疫性疾病时，体内的自身抗体可攻击胎盘组织，导致胎盘血管血栓形成，影响胎盘的血液供应，进而引起先兆流产。抗磷脂抗体综合征患者中，先兆流产的发生率较高。
同种免疫异常：母体对胚胎的免疫耐受失衡也可能导致先兆流产。正常妊娠时，母体免疫系统对胚胎产生的父源性抗原处于耐受状态，若这种耐受机制发生异常，母体免疫系统攻击胚胎，就会引发先兆流产。
环境因素
化学物质接触：孕妇接触某些有害化学物质，如铅、汞、苯、甲醛等，这些化学物质可通过胎盘进入胚胎体内，干扰胚胎的正常发育，增加先兆流产的风险。例如，长期在含有甲醛的环境中工作或生活的孕妇，其先兆流产的发生率可能会升高。
辐射暴露：孕妇受到过量的辐射照射，如接受X线检查、长期处于辐射环境中等，辐射可导致胚胎细胞染色体断裂、基因突变等，影响胚胎发育，引发先兆流产。
