结直肠炎性息肉总体预后较好，多数经治疗可改善且复发风险相对较低，但存在不良预后情况，如基础疾病、高龄、不良生活方式等会影响预后，极少数炎性息肉可能恶变，恶变后预后变差，早期发现恶变及定期复查很关键。
一、总体预后较好方面
1.多数炎性息肉经治疗后可改善
结直肠炎性息肉主要是由于结直肠黏膜长期受到炎症刺激引起的增生性病变。在去除相关炎症因素后，例如积极治疗肠道感染性疾病等，大部分炎性息肉可以逐渐消退，患者的预后相对良好。研究表明，对于由慢性结肠炎等炎症引起的炎性息肉，通过规范治疗炎症，约有60%-70%的炎性息肉会在一定时间内缩小甚至消失，患者的肠道功能可以恢复正常，一般不影响正常的生活和寿命。
从年龄因素来看，不同年龄段的患者预后有所差异但总体较好。对于儿童患者，若因感染性肠炎等引起的炎性息肉，在积极控制感染后，炎性息肉消退的可能性较大，因为儿童的肠道修复能力相对较强。而对于老年患者，只要能有效控制基础疾病（如合并的高血压、糖尿病等不影响炎症控制的情况），规范治疗炎症，炎性息肉的预后也较为乐观，虽然老年患者肠道功能恢复可能相对缓慢，但多数也能取得较好的预后效果。
生活方式方面，保持健康的生活方式有助于炎性息肉的预后。例如，戒烟限酒，因为吸烟和过量饮酒会加重肠道炎症，不利于炎性息肉的消退；保持规律的作息和适度的运动，运动可以促进肠道蠕动，改善肠道微环境，有利于炎症的控制和息肉的消退。对于有长期不良生活方式的患者，通过改变生活方式配合治疗，预后会更好。
2.复发风险相对较低
如果能持续去除炎症诱因，结直肠炎性息肉的复发风险较低。例如，对于因溃疡性结肠炎等慢性炎症性肠病引起的炎性息肉，在病情得到有效控制，炎症处于稳定状态时，炎性息肉复发的概率相对较小。但如果患者不能坚持治疗，再次暴露于炎症刺激因素下，如溃疡性结肠炎患者病情控制不佳，再次出现肠道炎症活动，就可能导致炎性息肉复发。不过总体而言，相比一些肿瘤性息肉，炎性息肉的复发风险要低很多。
二、存在不良预后的情况
1.基础疾病影响预后
对于本身合并有严重基础疾病的患者，如合并严重心脑血管疾病的患者，在治疗结直肠炎性息肉过程中，由于治疗操作可能带来的身体应激等情况，会增加预后的风险。例如，患者在进行内镜下炎性息肉切除时，可能因为心脑血管疾病导致手术风险增加，术后恢复也可能受到影响。对于合并免疫缺陷疾病的患者，肠道炎症难以控制，炎性息肉容易反复出现，预后相对较差。
在年龄因素上，高龄患者（如80岁以上）本身身体各器官功能衰退，对炎症的耐受能力和修复能力下降，在处理结直肠炎性息肉时，无论是选择内镜下治疗还是药物治疗，都面临更多挑战。例如，内镜下治疗时操作难度相对较大，术后发生并发症的风险较高；药物治疗时药物的代谢和不良反应的发生概率也会增加，从而影响炎性息肉的预后。
生活方式方面，如果患者不能严格遵循健康生活方式，继续接触炎症刺激因素，如持续大量进食辛辣刺激性食物、长期处于精神紧张状态等，会导致肠道炎症持续存在，炎性息肉复发的可能性增加，进而影响预后。例如，长期精神紧张会通过神经-内分泌系统影响肠道功能，加重肠道炎症，不利于炎性息肉的预后。
2.炎性息肉发生恶变情况
虽然炎性息肉恶变的概率较低，但仍有极少数情况炎性息肉可能发生恶变转化为肿瘤性病变。一旦发生恶变，患者的预后会明显变差。例如，炎性息肉发生癌变后，需要按照结直肠癌的治疗方案进行处理，包括手术、化疗等综合治疗，患者的生存时间和生活质量都会受到严重影响。对于这类患者，早期发现恶变是改善预后的关键，但炎性息肉恶变早期往往没有明显症状，容易被忽视，所以定期进行肠镜复查对于这类患者非常重要。在年龄方面，老年患者由于身体机能下降，对癌变的耐受和治疗反应相对较差，预后相对更差；在性别方面，目前并没有明确的性别差异导致恶变后预后不同的显著证据，但在治疗过程中需要根据患者的具体情况进行个体化治疗。生活方式方面，有不良生活方式的患者在发生恶变后，由于身体整体状态较差，也会影响预后的改善。
