疱疹性咽峡炎由肠道病毒引起，常见病毒有柯萨奇病毒A组及肠道病毒71型等，通过粪-口、呼吸道飞沫传播，5岁以下儿童易感，病毒侵入人体增殖形成病毒血症，致咽峡部病变及发热等症状。
传播途径
粪-口途径：肠道病毒可通过被污染的食物、水等经口传播。例如，儿童在接触了被肠道病毒污染的水源后，就有可能感染该病毒引发疱疹性咽峡炎。对于年龄较小的儿童，他们的卫生习惯相对较差，如喜欢用手接触物品后直接放入口中，若接触到被病毒污染的物体表面，再经口摄入病毒，就增加了感染风险。
呼吸道飞沫传播：患者咳嗽、打喷嚏时产生的飞沫中含有病毒，周围人群吸入这些飞沫后可能被感染。在幼儿园、学校等人员密集的场所，这种传播方式较为容易发生。比如，一个患有疱疹性咽峡炎的儿童在教室里咳嗽，其周围的其他儿童就有可能通过吸入含有病毒的飞沫而被感染。
易感人群及发病机制
易感人群：儿童尤其是5岁以下儿童较为易感。这是因为儿童的免疫系统尚未完全发育成熟，对肠道病毒的抵抗力相对较弱。随着年龄增长，免疫系统逐渐完善，感染的几率会相对降低，但在一些特殊情况下，如儿童处于疲劳、营养不良等状态时，也可能增加感染的易感性。
发病机制：肠道病毒通过口腔、鼻腔等黏膜侵入人体后，在局部黏膜和淋巴组织中增殖，然后进入血液循环形成病毒血症。病毒随血液循环到达咽部、口腔等部位的黏膜组织，在这些部位的细胞内复制，引起细胞病变、坏死，从而导致咽峡部出现疱疹、溃疡等病变，同时引发发热等全身症状。例如，病毒到达咽部黏膜细胞后，利用细胞内的物质进行自身的复制繁殖，破坏细胞的正常结构和功能，使得局部组织出现炎症反应，表现为疱疹和溃疡，并且引起机体的免疫反应，导致发热等症状的出现。
