小儿口腔疱疹的治疗包括一般治疗、药物治疗及特殊人群注意事项。一般治疗需休息、合理饮食及口腔护理；药物治疗有抗病毒及对症治疗药物；婴儿和有基础疾病小儿需特殊关注，婴儿要留意口腔和精神状态、轻柔护理及细心喂养，有基础疾病小儿要告知医生基础病情况以保障治疗安全有效。
口腔护理：保持口腔清洁，饭后可用温水或生理盐水漱口，年龄较小的患儿可由家长用棉签蘸取生理盐水轻轻擦拭口腔。这样做能清除口腔内的食物残渣和分泌物，防止继发感染，因为口腔内的细菌等容易在食物残渣存在的情况下滋生繁殖，加重病情。
药物治疗
抗病毒药物：如果是由病毒感染引起的口腔疱疹，如单纯疱疹病毒感染等，可在医生评估下使用抗病毒药物，如阿昔洛韦等（需遵医嘱使用）。抗病毒药物能抑制病毒复制，缩短病程，但要严格按照医生的指导使用，因为不同年龄段小儿对药物的耐受性等不同。
对症治疗药物：若小儿口腔疼痛明显，影响进食，可在医生指导下使用局部止痛药物，如利多卡因凝胶等，但低龄儿童应避免使用。对于发热的患儿，若体温在38.5℃以上且符合退热指征，可根据情况使用对乙酰氨基酚等退热药物，但需注意药物的使用禁忌和剂量等要严格遵循医生建议，因为小儿的肝肾功能等发育尚未完全成熟，药物代谢等与成人不同。
特殊人群注意事项
婴儿：婴儿患口腔疱疹时，家长要特别留意其口腔情况和精神状态。由于婴儿不会表达，家长需更频繁地观察口腔疱疹的变化以及婴儿是否有拒食、哭闹不止、发热不退等异常情况。在进行口腔护理时要更加轻柔，避免损伤婴儿口腔黏膜。同时，婴儿的喂养要格外细心，保证营养供给的同时防止因口腔疼痛而出现喂养困难等问题。
有基础疾病的小儿：对于本身患有其他基础疾病的小儿，如先天性心脏病、哮喘等，患口腔疱疹后病情可能受到影响，也可能在治疗过程中与基础疾病的治疗产生药物相互作用等。所以在治疗口腔疱疹时，要向医生详细告知小儿的基础疾病情况，医生在选择治疗药物和方法时会综合考虑，以确保治疗的安全性和有效性。
