手足口病多数患儿预后良好无明显后遗症，少数重症患儿可能遗留后遗症，包括神经系统方面的认知、行为、运动功能障碍，呼吸系统的肺功能受损，心血管系统的心肌损伤等，重症患儿病情恢复后需长期随访观察并进行早期干预和康复治疗以提高生活质量。
一、轻症手足口病
一般情况：大多数患儿为轻症，主要表现为手、足、口腔等部位的皮疹、疱疹或溃疡，伴有发热等症状。经过及时有效的治疗，一般在1-2周内即可痊愈，且不会留下后遗症。这类患儿年龄通常较小，生活方式相对简单，无基础病史等特殊情况，只要得到规范治疗，身体可完全恢复正常状态。
二、重症手足口病可能遗留的后遗症
神经系统方面
认知和行为问题：部分重症手足口病患儿可能出现神经系统受累，如脑炎等情况。在恢复后可能会存在认知功能障碍，表现为注意力不集中、学习能力下降等；也可能出现行为异常，例如情绪不稳定、易激惹等。这与疾病过程中神经系统受到病毒侵袭，导致神经细胞损伤等因素有关。对于儿童患者来说，神经系统尚在发育中，受影响后恢复相对复杂，需要长期的康复干预来促进神经功能的恢复。
运动功能障碍：少数重症患儿可能出现肢体运动障碍，如肌肉无力、肌肉萎缩、运动协调性差等。这是因为病毒侵犯了中枢神经系统或周围神经，影响了运动神经的功能。对于年龄较小的患儿，由于其运动系统还在不断发育，运动功能障碍可能会对其未来的行走、肢体活动等产生长期影响，需要进行康复训练等干预措施来最大程度恢复运动功能。
呼吸系统方面：极少数重症手足口病患儿可能出现呼吸衰竭等严重呼吸系统受累情况，经过治疗后可能会遗留肺功能受损，表现为肺活量下降、活动后气短等。这与疾病过程中肺部组织受到损伤有关，对于儿童患者，肺功能的恢复需要较长时间的观察和康复措施，并且要注意避免再次发生呼吸道感染等加重肺功能损害的情况。
心血管系统方面：个别重症手足口病患儿可能出现心血管系统受累，如心肌炎等，恢复后可能会遗留心肌损伤相关的后遗症，例如心脏收缩或舒张功能轻度异常等，在后续生活中需要注意避免过度劳累等，以减少对心脏功能的影响，对于儿童患者，要定期进行心脏相关检查，监测心脏功能变化。
总之，大多数手足口病患儿预后良好无后遗症，重症患儿有遗留后遗症的可能，对于重症患儿在病情恢复后需要长期随访观察，针对可能出现的后遗症进行早期干预和康复治疗，以提高患儿的生活质量。
