肛乳头肥大有多种症状表现，局部不适时较大肥大肛乳头可致肛门异物感、坠胀感，儿童可能有排便后搔抓肛门情况；排便异常时可致排便不尽感，严重时肥大肛乳头脱出嵌顿引发剧烈疼痛，老年患者易因之便秘且形成恶性循环；少数患者有便血，量少，粪便表面带血或手纸染血；脱出不能回缩时会致肛门括约肌痉挛引发剧烈疼痛，女性经期、糖尿病患者疼痛有其特殊情况。
较小的肛乳头肥大通常无明显症状，但较大的肛乳头肥大可能会导致肛门部的不适感觉，患者可自觉肛门内有异物感，尤其是在排便时，这种异物感可能会更加明显，部分患者会感觉肛门部坠胀。例如，当肥大的肛乳头接近肛门外口时，在排便过程中，肥大的组织会受到粪便的摩擦和刺激，从而引发肛门的异物感与坠胀感。
对于儿童患者，由于其表达能力相对有限，家长可能会观察到孩子在排便后有搔抓肛门的行为，这可能提示孩子存在肛门部的不适，需要引起重视。
排便异常
肛乳头肥大可能会影响正常的排便过程，导致排便不尽感。患者在排便后，仍感觉直肠内有粪便未排净，需要再次用力排便，但实际上并没有更多的粪便排出。这是因为肥大的肛乳头占据了直肠内的空间，干扰了正常的排便反射。
在一些情况中，肥大的肛乳头可能会脱出肛门外。如果是部分脱出，在排便后可自行缩回肛门内；但如果是完全脱出且不能及时回缩，就可能会引起嵌顿，导致肛门剧烈疼痛，此时患者的排便会受到严重影响，可能会出现排便困难、疼痛性排便等情况。对于老年患者，本身肠道蠕动功能相对较弱，再加上肛乳头肥大导致的排便异常，更容易出现便秘等问题，而便秘又可能进一步加重肛乳头肥大的症状，形成恶性循环。
出血
少数患者可能会出现便血症状，一般出血量较少，多表现为粪便表面带血或便后手纸上有少量鲜血。这是因为肥大的肛乳头在排便过程中受到粪便的摩擦，导致局部黏膜破损而引起出血。例如，当干燥的粪便通过肛门时，会摩擦到肥大的肛乳头，使局部的小血管破裂，从而出现便血现象。
儿童患者出现便血时，家长需要特别注意与其他肠道疾病进行鉴别诊断，因为儿童便血的原因可能较为多样，如肠息肉等，需要结合患儿的具体情况进行综合判断。
疼痛
当肛乳头肥大脱出肛门外不能回缩时，会引起肛门括约肌痉挛，导致剧烈疼痛。这种疼痛多为刺痛或胀痛，患者在行走、坐立、排便等情况下都会受到影响。对于女性患者，在月经期间由于身体的特殊生理状况，肛门周围的敏感度可能会增加，此时肛乳头肥大引起的疼痛可能会更加明显。
对于患有基础疾病如糖尿病的患者，由于其机体的修复能力相对较弱，当肛乳头肥大出现疼痛症状时，恢复时间可能会相对较长，而且需要更加注意局部的清洁和护理，以防止感染等并发症的发生。
