肛门囊肿有多种常见症状，婴幼儿局部可出现可见肿块、哭闹不安等，成年人可摸到肛门周围肿块；婴幼儿可能因表达受限通过哭闹等提示疼痛，成年人囊肿增大或继发感染时会有不同程度疼痛；婴幼儿会有排便习惯和性状改变，成年人有排便不尽感等；婴幼儿肛周皮肤红肿明显，成年人肛门周围皮肤红肿且温度可能升高；肛门囊肿继发严重感染时婴幼儿可出现高热等，成年人也可能发热，严重时会有寒战高热等全身感染症状。
婴幼儿：可能因先天发育等因素导致肛门囊肿，局部可出现可见的肿块，家长可能在给孩子换尿布等日常护理中发现肛周有异常隆起。比如一些先天性肛门直肠畸形相关囊肿可能在出生后不久就被发现肛周有肿块表现。
成年人：多因肛腺感染等原因引发，肛门周围可摸到圆形或椭圆形的肿块，一般边界清楚，质地可能软或韧，随着病情发展，肿块可能会有增大趋势。例如肛腺感染后炎症蔓延形成囊肿，可在肛门周围触及到肿块。
疼痛
婴幼儿：由于婴幼儿表达能力有限，可能会出现哭闹不安等表现，尤其是在囊肿受到压迫、摩擦或者感染加重时，可能会通过异常哭闹来提示肛周不适。比如囊肿继发感染时，婴幼儿会因为局部疼痛而出现烦躁、拒食等情况。
成年人：囊肿较小的时候可能疼痛不明显，当囊肿增大或者继发感染时，会出现不同程度的疼痛。若囊肿继发细菌感染形成脓肿，会有明显的胀痛、跳痛等，行走、坐立等都会受到影响。比如肛门囊肿合并感染形成肛周脓肿时，患者会感觉肛门局部有剧烈的跳痛，影响正常的坐立和行走。
排便异常
婴幼儿：可能会出现排便习惯的改变，比如排便次数增多或者减少，粪便性状也可能发生变化，如粪便变稀或者干结等。这是因为肛门囊肿可能会刺激直肠，影响肠道的正常蠕动和排便功能。例如囊肿较大压迫直肠时，婴幼儿可能会出现排便困难、大便变细等表现。
成年人：可能会有排便不尽感，感觉大便排不干净，或者出现便秘情况。当囊肿影响到肛管直肠的正常解剖结构和功能时，会干扰正常的排便过程。比如肛门囊肿导致肛管狭窄时，患者会出现排便困难、大便变细等症状，同时可能伴有肛门坠胀感。
红肿
婴幼儿：肛周皮肤可能出现红肿表现，尤其是囊肿部位周围的皮肤，因为婴幼儿皮肤比较娇嫩，炎症反应可能会更明显地通过红肿表现出来。比如囊肿继发感染时，肛周皮肤会迅速出现红肿，边界可能不太清晰。
成年人：肛门周围皮肤可见红肿，炎症较轻时红肿范围可能较小，炎症加重时红肿范围会扩大，皮肤温度可能升高。例如肛门囊肿合并感染形成肛周脓肿时，局部皮肤红肿明显，且伴有皮温升高。
发热
婴幼儿：当肛门囊肿继发严重感染时，可能会出现发热症状，体温可升高至38℃以上。这是因为身体的免疫系统对感染进行反应，导致体温调节中枢紊乱。比如肛门囊肿感染扩散引起全身感染时，婴幼儿会出现高热、精神萎靡等表现。
成年人：也可能出现发热情况，一般为低热或中度发热，但如果感染严重，也可能出现高热。当感染扩散形成脓毒血症时，成年人可能会出现寒战、高热等全身感染症状。
