霉菌性食管炎不治疗通常不会自愈，病情会逐渐加重，对食管黏膜持续损伤且引发并发症风险增加，不同人群如儿童、成年、老年患者不治疗均会产生不良影响，儿童会影响生长发育，成年会影响日常生活工作及基础疾病控制，老年会使病情恶化并发其他严重疾病。
病情发展方面
对食管黏膜的持续损伤：真菌会不断侵袭食管黏膜，导致黏膜充血、水肿、糜烂等情况进一步恶化，患者会出现更为明显的吞咽困难、胸骨后疼痛等症状，严重影响进食，进而导致营养摄入不足，影响患者的身体状况，比如免疫力可能会进一步降低，更易受到其他病原体的感染。
引发并发症风险增加：随着病情进展，可能会引起食管狭窄、出血等并发症。食管狭窄会使吞咽困难症状加剧，严重影响患者的生活质量；而食管出血可能会导致贫血等问题，对患者的身体健康造成更大的危害。
不同人群的情况及应对
儿童患者：儿童本身免疫系统相对不完善，患霉菌性食管炎后若不治疗，病情进展可能更快。儿童可能会出现拒食、哭闹等表现，长期不治疗会影响生长发育，因为营养摄入受限会影响身高、体重等的正常增长，所以儿童一旦怀疑患有霉菌性食管炎，应及时就医治疗。
成年患者：成年患者若不治疗，病情迁延不愈会影响日常生活和工作，比如无法正常进食会导致体力不支，影响工作效率等。而且成年患者如果本身有基础疾病，如糖尿病等，血糖控制不佳时更容易发生霉菌性食管炎且不治疗会使基础疾病控制更困难，因为身体处于慢性炎症和营养失衡状态不利于基础疾病的管理。
老年患者：老年患者机体功能衰退，免疫力低下，霉菌性食管炎不治疗时，病情恶化可能导致更严重的后果，如营养不良会使老年患者的身体更虚弱，容易并发其他系统的疾病，像肺部感染等，而肺部感染对于老年患者来说是较为严重的并发症，可能危及生命。
