穿通性鼻毛囊炎局部有鼻部皮肤红肿、疼痛、毛囊口丘疹脓疱、结痂等症状，病情较轻时全身症状不明显，炎症扩散感染加重可能出现低热等全身症状，免疫力低人群全身症状可能更明显。
疼痛：患者往往会感觉到鼻部有疼痛不适，这种疼痛通常是因为炎症刺激了周围的神经末梢所致，疼痛程度可轻可重，病情较轻时可能只是轻微的胀痛、隐痛，随着病情发展，炎症加重，疼痛可能会变得较为明显，甚至在触碰鼻部时疼痛加剧，影响患者的日常活动，比如影响患者的呼吸、触碰鼻部等动作。
毛囊口丘疹、脓疱：在受累的毛囊口处会出现丘疹，随后可能发展为脓疱。这是因为毛囊内的炎症进一步发展，毛囊内的皮脂腺、角质细胞等与炎症细胞混合形成丘疹，随着炎症的进展，丘疹内会出现化脓现象，从而形成脓疱，脓疱大小不一，有的可能如针尖大小，有的相对较大，脓疱破裂后可能会有脓性分泌物排出。
结痂：当脓疱破裂后，流出的脓性分泌物等干燥后会形成结痂，结痂覆盖在鼻部病变部位，影响局部皮肤的外观，而且如果患者不自觉地搔抓等，可能会导致结痂脱落，进而可能引起出血、感染加重等情况，不同患者结痂的厚薄、范围等也存在差异。
全身症状
一般来说，单纯的穿通性鼻毛囊炎如果病情较轻，全身症状不明显。但如果炎症扩散，感染加重，可能会出现低热等全身症状。这是因为机体对感染的炎症反应可能会引起体温调节中枢的轻微波动，导致体温轻度升高，但这种全身症状相对较少见，多数患者主要还是以局部症状为主。不过对于免疫力较低的人群，如儿童、老年人或者患有基础疾病的人群，感染扩散的风险相对较高，全身症状可能会更明显一些，需要密切关注。例如儿童由于免疫系统尚未完全发育成熟，在患穿通性鼻毛囊炎时，相对成人更容易出现感染扩散的情况，若出现全身症状更要及时就医处理。
