滤泡性咽炎常见症状有咽部异物感（如进食时不明显、吞咽唾液时突出，儿童频繁清嗓、成人感有异物）、咽部不适感（如痒、灼热、干燥等，儿童哭闹不安、成人清晰描述）、咳嗽（刺激性无痰或少量黏液痰，儿童频繁、夜间加重，成人影响生活休息），检查可见咽部黏膜慢性充血，咽后壁散在或融合成片的颗粒状淋巴滤泡，儿童淋巴滤泡更明显数量多，成人相对成人化。
咽部异物感：患者会感觉咽部有异物，咳之不出，咽之不下，就好像总有东西堵在那里一样。这种异物感在进食时可能并不明显，但在吞咽唾液时会比较突出，尤其在晨起时较为明显，这是因为夜间睡眠时咽部分泌物积聚，刺激咽部神经所致。对于儿童来说，可能会表现为频繁清嗓子的动作，因为他们无法准确表达咽部的异物感；而成年人可能会更明确地感觉到咽部有异物存在。
咽部不适感：患者常感觉咽部发痒、灼热、干燥等。儿童可能因为咽部不适而出现哭闹不安等情况，而成人则会更清晰地描述这种不适的感觉。例如，有些患者会觉得咽部像有蚂蚁爬一样的瘙痒感，或者像被火烤过一样的灼热感。
咳嗽：由于咽部有炎症刺激，患者会出现刺激性咳嗽。一般咳嗽无痰或者仅有少量黏液痰。儿童的咳嗽可能相对更频繁，而且由于儿童的呼吸道发育尚未完全成熟，咳嗽时可能更容易出现呼吸急促等情况；成人咳嗽时相对可能更能控制，但也会影响日常生活和休息。在夜间，这种咳嗽可能会加重，因为夜间环境相对安静，咽部的刺激更容易被察觉，从而引发咳嗽。
咽部黏膜表现：检查时可见咽部黏膜慢性充血，咽后壁可见散在的淋巴滤泡，这些淋巴滤泡呈颗粒状隆起，有的可融合成片。儿童的咽部淋巴组织相对更为丰富，所以在滤泡性咽炎时，儿童咽后壁的淋巴滤泡可能更为明显且数量较多；而成人咽后壁的淋巴滤泡表现可能相对成人化一些，但本质都是咽部淋巴组织的增生反应。
