腹部CT与肠镜有差异，有肠道症状、腹部CT提示肠道可疑病变时通常需做肠镜，腹部CT已明确与肠道无关的腹部疾病且无需肠道细节检查时可能无需做肠镜，特殊人群（儿童、老年人）做肠镜需谨慎评估。
需做肠镜的情况
有肠道症状者：若患者有长期腹痛、腹泻、便血、大便习惯改变（如便秘与腹泻交替）等症状时，即使做了腹部CT，通常也需要做肠镜。例如，长期便血的患者，腹部CT可能发现不了具体的肠道出血原因，而肠镜可以直接看到肠道内是否有溃疡、肿瘤等导致出血的病灶。对于年龄在40岁以上，尤其是有肠道肿瘤家族史的人群，即使没有明显症状，也建议定期进行肠镜筛查，因为肠道肿瘤的发生可能在早期没有明显的腹部CT可察觉的形态改变，但肠镜能发现早期的病变。
腹部CT提示肠道可疑病变：当腹部CT发现肠道有可疑的占位性病变等情况时，需要通过肠镜进一步明确病变的性质，是炎症、息肉还是肿瘤等。比如腹部CT发现肠道有肿块影，但是仅通过CT无法确定其是良性还是恶性，这时候就需要肠镜下取组织活检来明确诊断。
无需做肠镜的情况
腹部CT已明确诊断且无需肠道细节检查：如果腹部CT已经非常明确地诊断了腹部的疾病，而且该疾病与肠道关系不大，不需要了解肠道黏膜情况时，可能不需要做肠镜。例如，单纯的胆囊炎通过腹部CT已经确诊，且病情与肠道无关，此时可能不需要额外做肠镜检查。
对于特殊人群，比如儿童，若考虑腹部疾病，在决定是否做肠镜时要更加谨慎。儿童做肠镜可能会有不适，需要充分评估病情。如果是怀疑儿童有肠道先天性畸形等情况，可能需要在麻醉等安全保障下进行肠镜检查；而对于没有肠道相关典型症状且腹部CT已能明确腹部其他疾病的儿童，可能暂时不考虑做肠镜。老年人做肠镜时要评估其心肺功能等情况，因为肠镜检查可能会带来一定的应激，对于心肺功能较差的老年人，需要先评估能否耐受肠镜检查，再综合判断是否需要进行肠镜检查。
