鼻中隔穿孔的治疗包括病因治疗、局部治疗和手术治疗。病因治疗需针对感染性、外伤性等不同因素分别处理；局部治疗有鼻腔润滑、鼻黏膜烧灼、鼻腔填塞等；手术治疗适用于较大且保守治疗无效的穿孔，采用穿孔修补术，不同年龄患者治疗需考虑各自特点。
感染性因素：若由鼻腔感染引起，需积极控制感染。例如细菌感染导致的鼻中隔穿孔，明确病原菌后可选用合适的抗生素进行抗感染治疗，但具体药物选择需依据病原菌药敏结果，不同年龄、病史等因素会影响抗生素的选择，儿童使用抗生素需尤其注意药物的安全性和剂量等问题，要避免使用可能对儿童产生不良影响的药物。
外伤性因素：对于因外伤导致的鼻中隔穿孔，要避免再次损伤鼻腔，如避免用力擤鼻等。不同年龄的患者外伤性鼻中隔穿孔的处理需考虑其自身的愈合能力等因素，儿童愈合能力相对较强，但也需注意保护鼻腔环境促进愈合。
其他因素：如果是由职业性粉尘、化学物质刺激等因素引起，需让患者脱离相应的刺激环境。不同生活方式的患者，如长期处于粉尘环境工作的人群，脱离刺激环境是重要的治疗基础。
局部治疗
鼻腔润滑：使用油性滴鼻剂，如液体石蜡等，保持鼻腔黏膜湿润，减少鼻腔干燥引起的不适，不同年龄患者使用时需注意药物的剂型等是否合适，儿童使用时要防止误吸等情况。
鼻黏膜烧灼：对于较小的穿孔可尝试用化学腐蚀剂烧灼穿孔边缘，促使黏膜再生，但要注意操作的精准性，避免损伤周围正常组织，不同病史的患者进行烧灼治疗需评估其鼻腔的基础状况。
鼻腔填塞：可使用可吸收的材料填塞穿孔处，起到暂时封闭穿孔的作用，为黏膜修复创造条件，填塞时要注意操作轻柔，避免对鼻腔造成新的损伤。
手术治疗
穿孔修补术：适用于较大的、保守治疗无效的鼻中隔穿孔。手术方法有多种，如黏骨膜瓣转移修补术等。手术需根据患者的具体情况选择合适的术式，年龄较小的患者手术耐受性等与成人不同，需充分评估手术风险。例如儿童患者身体各器官功能发育尚未完全成熟，手术中对麻醉等的耐受以及术后的恢复等都需要特别关注，要确保手术在安全的前提下进行。
