早上起床喉咙干痛可能由多种因素引起，环境因素包括空气干燥和空气污染；疾病因素有上呼吸道感染、慢性咽炎、过敏因素；生活方式因素涉及用嗓过度、饮食因素和缺水，不同人群受不同因素影响程度有别，如儿童对空气干燥耐受更弱，过敏体质人群易因过敏出现喉咙干痛，教师等用嗓过度人群易因用嗓过度发病等。
空气污染：如果居住环境或睡眠场所存在空气污染，如雾霾、有害气体等，其中的颗粒物、有害物质会刺激咽喉黏膜，导致早上起床喉咙干痛。长期处于污染环境中的人群风险更高，比如长期生活在工业污染严重区域或经常接触汽车尾气的人。
疾病因素
上呼吸道感染：病毒或细菌感染引起的上呼吸道感染，如普通感冒、急性咽炎等，炎症会刺激咽喉部黏膜，导致喉咙干痛。各个年龄段均可发病，儿童由于免疫系统发育不完善，相对更容易患上呼吸道感染从而出现喉咙干痛。例如普通感冒初期，往往先出现喉咙不适，随后出现流涕、鼻塞等症状。
慢性咽炎：患有慢性咽炎的人，咽喉部长期处于炎症状态，早上起床时炎症可能会有一定程度的加重，出现喉咙干痛的情况，且症状可能会持续较长时间。成年人患病比例相对较高，长期吸烟、饮酒、用嗓过度的人群更易罹患慢性咽炎。
过敏因素：如果对床上用品的材质（如螨虫、花粉等过敏原）过敏，夜间睡眠时接触过敏原后可能引发咽喉部的过敏反应，导致早上起床喉咙干痛。过敏体质人群更易出现这种情况，不同年龄都可能发生，儿童可能对尘螨过敏更为常见。
生活方式因素
用嗓过度：前一天过度用嗓，如长时间说话、唱歌、喊叫等，会使咽喉部肌肉疲劳，黏膜受损，早上起床出现喉咙干痛。经常需要大量用嗓的人群，如教师、歌手等，发病风险较高。
饮食因素：前一天食用过多辛辣、刺激性食物，或者饮酒过量，会刺激咽喉黏膜，导致早上起床喉咙干痛。不同年龄人群均可因不良饮食引发，例如年轻人聚餐时可能因进食辛辣食物后出现此类症状。
缺水：夜间睡眠期间身体处于缺水状态，没有及时补充水分，会使咽喉部黏膜干燥，早上起床出现喉咙干痛。各个年龄段都可能因为缺水出现该症状，尤其老年人可能因口渴感觉不敏感，更容易在夜间缺水。
