动脉瘤样骨囊肿病因未完全明确，可能与局部血管异常、创伤、遗传因素及骨内血管畸形相关，局部血管异常致压力变化等、创伤引发局部修复异常、部分病例存基因异常、骨内先天性血管畸形致血流异常冲击骨组织等均可促使其形成。
一、血管因素
局部血管异常：有研究表明，动脉瘤样骨囊肿可能与局部血管的异常增生和血流动力学改变有关。局部存在的异常血管团，使得血管内压力发生变化，进而导致骨组织内出现类似动脉瘤样的扩张改变。例如，某些区域的动脉供血增加，静脉引流不畅，造成局部血液淤积，长期如此就可能促使动脉瘤样骨囊肿的形成。这种血管因素在青少年群体中相对更为常见，可能与青少年处于生长发育阶段，血管系统相对活跃，容易出现血管调节失衡有关。
二、创伤因素
创伤引发的局部反应：创伤被认为是导致动脉瘤样骨囊肿的一个重要因素。骨折或局部软组织损伤后，局部组织会出现修复反应，在修复过程中可能引发血管的异常增生和骨组织的异常改变。比如，骨折部位周围的血管受到损伤后，机体启动修复机制，新生血管的生长如果出现异常调控，就可能导致动脉瘤样骨囊肿的发生。对于儿童和青少年来说，他们活泼好动，发生创伤的几率相对较高，因此创伤因素在该年龄段动脉瘤样骨囊肿的发病中具有一定重要性。
三、遗传因素
遗传易感性：有一些研究提示，动脉瘤样骨囊肿可能与遗传因素存在一定关联。部分病例可能存在某些基因的异常，使得个体更容易发生骨组织的这种特殊病变。然而，目前对于具体涉及的遗传基因及遗传模式还不是完全清晰，需要进一步深入研究。遗传因素在不同性别之间的影响可能没有明显的特异性差异，但在有家族遗传倾向的人群中，发病风险相对会有所升高，这类人群需要更加密切地关注骨骼健康状况，以便早期发现和干预。
四、骨内血管畸形相关
骨内血管畸形的持续影响：骨内存在的先天性血管畸形也是导致动脉瘤样骨囊肿的潜在原因之一。血管畸形使得骨内的血液动力学环境发生改变，长期的血流异常冲击骨组织，引起骨组织的吸收和破坏，进而逐渐形成类似动脉瘤样骨囊肿的病变结构。这种血管畸形可能在胚胎发育时期就已经存在，随着个体的生长发育逐渐显现出相应的临床症状。不同年龄阶段都可能因这种血管畸形而发病，但在生长发育快速的时期，由于骨组织的活跃生长，可能会加速病变的发展。
