胃食管反流的相关因素包括食管下括约肌功能障碍（如激素影响、结构受损、肥胖、老年人LES功能减退等致其压力降低）、食管酸清除障碍（食管蠕动异常、唾液分泌减少等致反流物清除异常）、胃排空延迟（胃内压力高于LES压力致反流，如糖尿病胃轻瘫、术后患者）、食管黏膜防御机制减弱（长期吸烟饮酒、药物等致其屏障功能减弱）以及饮食因素（高脂肪、巧克力、咖啡、浓茶等降低LES压力）、妊娠（孕激素致LES压力降低及子宫压迫胃部）、遗传因素（部分研究发现有遗传易感性）。
食管酸清除障碍
正常情况下，食管对反流物有清除作用，主要通过食管蠕动和唾液中和来实现。当食管蠕动异常时，如硬皮病患者，食管蠕动功能减退，不能及时将反流物清除，导致反流物在食管内停留时间延长，对食管黏膜的刺激增加，从而引发胃食管反流。此外，唾液分泌减少也会影响食管酸清除，比如一些老年人唾液分泌功能下降，或者服用某些药物（如抗胆碱能药物等）导致唾液分泌减少，都可能增加胃食管反流的发生几率。
胃排空延迟
胃排空延迟会使胃内压力升高，当胃内压力高于LES压力时，就容易导致胃内容物反流。例如，糖尿病患者常伴有胃轻瘫，这是由于自主神经病变影响了胃的蠕动功能，从而引起胃排空延迟，增加胃食管反流的发生风险；另外，一些手术后的患者，如胃大部切除术患者，也可能出现胃排空障碍，进而引发胃食管反流。
食管黏膜防御机制减弱
食管黏膜的屏障功能包括上皮前、上皮和上皮后屏障。当食管黏膜防御机制减弱时，即使有少量反流物，也容易造成食管黏膜损伤。例如，长期吸烟、饮酒的人群，烟草中的尼古丁和酒精等物质会损伤食管黏膜的屏障功能；某些药物（如非甾体类抗炎药）也可能破坏食管黏膜的防御机制，使得胃食管反流时更容易出现食管黏膜的炎症、糜烂等病变。
其他因素
饮食因素：过多食用高脂肪、巧克力、咖啡、浓茶等食物，可降低LES压力，促进反流。比如大量摄入高脂肪食物后，会刺激胆囊收缩素分泌，引起LES松弛；喝咖啡、浓茶等可使LES压力降低，从而增加胃食管反流的发生概率。
妊娠：女性在妊娠期间，由于孕激素水平升高，会使LES压力降低，同时增大的子宫压迫胃部，导致胃内压力升高，容易发生胃食管反流。一般在妊娠中晚期较为明显，分娩后症状多可缓解。
遗传因素：部分研究发现，胃食管反流病具有一定的遗传易感性，某些基因的突变可能与个体发生胃食管反流的风险增加有关，但具体的遗传机制还在进一步研究中。
