晨起喉咙痛可能由多种因素引起，包括环境因素（空气干燥、空气污染）、上呼吸道感染（普通感冒、急性扁桃体炎）、咽喉部本身疾病（慢性咽炎、反流性咽喉炎）及其他因素（用嗓过度、过敏因素），不同因素影响不同年龄段人群的情况各有特点。
一、环境因素
（一）空气干燥
室内空气过于干燥时，夜间睡眠过程中，呼吸道黏膜水分易丢失，导致喉咙黏膜干燥，晨起就可能出现喉咙痛。尤其是在冬季使用暖气或空调的环境下，这种情况较为常见。不同年龄段人群受影响程度相似，但婴幼儿因鼻腔、咽喉等呼吸道相对狭窄，空气干燥对其影响可能更明显，更容易出现喉咙不适。
（二）空气污染
如果睡眠环境存在空气污染，如烟雾（包括二手烟）、粉尘等，这些有害物质会刺激喉咙黏膜，引发炎症反应，导致早上睡醒喉咙痛。长期处于污染环境中的人群，如长期吸烟人群、生活在工业污染区附近的人群，出现这种情况的概率相对较高。
二、上呼吸道感染
（一）普通感冒
病毒感染引起的普通感冒，早期可出现喉咙不适，随着病情发展会出现喉咙痛等症状。各个年龄段均可发病，儿童由于免疫系统尚未完全发育成熟，相对更容易患普通感冒且更易出现喉咙痛症状。病毒在夜间睡眠时仍在体内活跃，会持续刺激喉咙黏膜，导致晨起喉咙痛。
（二）急性扁桃体炎
细菌（如A组乙型溶血性链球菌）感染引发的急性扁桃体炎，患者会出现喉咙痛，尤其在晨起时可能感觉疼痛加重。儿童扁桃体相对较大，急性扁桃体炎在儿童中较为常见，且病情可能发展较快。炎症导致扁桃体红肿，刺激周围神经，引起疼痛。
三、咽喉部本身疾病
（一）慢性咽炎
本身患有慢性咽炎的患者，咽喉部黏膜处于慢性炎症状态，夜间睡眠时咽喉部分泌物相对减少，局部抵抗力下降，炎症可能会相对加重，从而导致早上睡醒喉咙痛。长期吸烟、饮酒、用嗓过度的人群更容易患慢性咽炎，其中成年人患病比例相对较高，但儿童如果长期接触刺激性物质也可能发病。
（二）反流性咽喉炎
胃内容物反流至咽喉，刺激咽喉黏膜，引起炎症，导致喉咙痛。尤其是在睡眠时，平躺姿势更易导致胃内容物反流，从而在晨起出现喉咙痛。肥胖人群、妊娠女性由于腹部压力增加等原因，更容易出现反流性咽喉炎；成年人发病相对多见，但儿童如果存在食管下括约肌功能异常等情况也可能患病。
四、其他因素
（一）用嗓过度
前一天过度用嗓，如长时间唱歌、大声讲话等，会使喉咙黏膜疲劳、受损，夜间休息后晨起可能出现喉咙痛。经常需要用嗓的职业人群，如教师、歌手等，更容易出现这种情况，各个年龄段都可能发生，但成年人由于职业因素更易频繁出现。
（二）过敏因素
如果对床上用品的材质（如尘螨、羽绒等）过敏，夜间睡眠时接触过敏原，会引起咽喉部过敏反应，出现喉咙痛。过敏体质人群更易发生，儿童和成年人都可能因接触过敏原而发病，春季和秋季等过敏高发季节更需注意。
