慢性萎缩性胃炎的发病受多种因素影响，幽门螺杆菌感染是最主要病因，其可通过分解尿素等损伤胃黏膜；饮食习惯方面，长期高盐、大量饮酒、食用辛辣刺激性食物会损伤胃黏膜引发病变；自身免疫因素可致自身免疫性胃炎，多见于中老年女性；遗传因素使有遗传易感性个体患病风险增加；年龄上老年人概率高；性别在特定类型有差异；长期精神压力大等生活方式因素也会增加患病风险。
饮食习惯
长期高盐饮食：高盐饮食会损伤胃黏膜屏障。高浓度的盐会直接刺激胃黏膜，导致胃黏膜上皮细胞凋亡等损伤，长期如此易引发胃黏膜的慢性炎症，进而可能促使萎缩性胃炎的发生发展。不同年龄人群对高盐饮食的耐受和损伤反应有所不同，儿童长期高盐饮食可能影响其尚未发育完善的胃黏膜功能，而中老年人群本身胃黏膜功能逐渐减退，更易受高盐饮食的不良影响，男性和女性在这方面的易感性无显著差异，但有高盐饮食病史的人群患慢性萎缩性胃炎风险更高。
长期大量饮酒：酒精中的乙醇会直接毒害胃黏膜，引起胃黏膜充血、水肿、糜烂等损伤，长期大量饮酒还会影响胃黏膜的血液循环和自身修复机制，导致胃黏膜萎缩等病变。年轻人若有长期大量饮酒史，由于其新陈代谢相对旺盛，可能初期症状不明显但损伤已在累积，中老年人群本身胃黏膜功能衰退，酒精对其胃黏膜的损伤更为严重，男性相对女性可能因饮酒习惯更普遍而更易受其影响，有长期大量饮酒病史的人群患慢性萎缩性胃炎的几率大大增加。
长期食用辛辣刺激性食物：辛辣刺激性食物如辣椒等，会反复刺激胃黏膜，使胃黏膜处于慢性炎症状态，长期刺激可导致胃黏膜萎缩。不同年龄人群对辛辣刺激性食物的耐受度不同，儿童胃肠道更娇嫩，长期食用易引发胃肠功能紊乱进而影响胃黏膜，中老年人群胃黏膜敏感性增加，更易受刺激，男性和女性在这方面无明显性别差异，但有长期食用辛辣刺激性食物病史的人群患病风险较高。
自身免疫因素
自身免疫性胃炎是由于机体产生针对壁细胞或内因子的自身抗体，导致壁细胞受损，胃酸分泌减少，进而引起胃体黏膜萎缩。这类胃炎多见于中老年人群，女性发病多于男性。患者体内存在的自身抗体可攻击胃黏膜的壁细胞，影响维生素B的吸收，导致巨幼细胞贫血等并发症。有自身免疫性疾病家族史的人群患自身免疫性胃炎相关的慢性萎缩性胃炎风险更高，病史方面，既往有自身免疫性疾病发作的人群更易引发胃黏膜的自身免疫损伤。
遗传因素
遗传易感性在慢性萎缩性胃炎的发病中也起到一定作用。某些基因的多态性可能增加个体患慢性萎缩性胃炎的风险。不同家族中由于遗传基因的差异，后代患慢性萎缩性胃炎的概率有所不同。例如，某些与胃黏膜修复、炎症反应相关的基因发生突变或多态性改变时，个体对各种致病因素的易感性会增加，年龄较小的人群若有遗传易感性，可能在较早阶段就出现胃黏膜的病理改变，而有家族遗传病史的人群需更密切关注胃部健康。
其他因素
年龄因素：随着年龄增长，胃黏膜的生理功能逐渐衰退，包括胃黏膜的血流量减少、细胞更新速度减慢、防御修复能力下降等，所以老年人患慢性萎缩性胃炎的概率相对较高。儿童和青少年胃黏膜相对较为娇嫩但功能处于发育阶段，一般较少患慢性萎缩性胃炎，但如果有上述多种不良因素长期影响也可能发病。
性别因素：虽然总体上男女在慢性萎缩性胃炎发病上无绝对显著差异，但在自身免疫性胃炎等特定类型中女性相对多见，而在幽门螺杆菌感染相关的慢性萎缩性胃炎中，不同性别感染概率可能因生活习惯等因素有一定差异，但不是主要决定因素。
生活方式因素：除了前面提到的饮食习惯外，长期精神压力过大也可能通过影响神经内分泌调节，导致胃黏膜血液循环障碍和胃酸分泌失调，从而增加患慢性萎缩性胃炎的风险。有长期精神压力过大病史的人群，无论是哪个年龄、性别，都可能因神经内分泌紊乱而影响胃部健康。
