肠胃炎的病因包括感染因素和非感染因素。感染因素有病毒（轮状病毒、诺如病毒等）、细菌（大肠杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌等）、寄生虫（蓝氏贾第鞭毛虫、溶组织内阿米巴等）感染；非感染因素包含饮食（食物过敏、饮食不规律或不洁）、药物（非甾体类抗炎药、抗生素）、其他（腹部着凉、应激状态）等因素，不同因素引发肠胃炎的机制和表现各有不同。
一、感染因素
（一）病毒感染
1.轮状病毒：是婴幼儿肠胃炎的常见病原体之一，主要通过粪-口途径传播。全球范围内，轮状病毒每年导致大量婴幼儿腹泻，在我国，婴幼儿感染轮状病毒后易引发肠胃炎，其发病机制是病毒在小肠绒毛上皮细胞内复制，导致细胞功能受损，影响肠道对水分和电解质的吸收，从而引起腹泻、呕吐等肠胃炎症状，多见于秋冬季节。
2.诺如病毒：也是引起肠胃炎的常见病毒，可在学校、医院、社区等人群聚集场所引起暴发流行。诺如病毒感染性强，通过污染的食物、水或接触被污染的物品传播。病毒感染肠道后，会引起肠道黏膜炎症，导致患者出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状，病程一般较短，但传播速度快。
（二）细菌感染
1.大肠杆菌：某些血清型的大肠杆菌可引起肠胃炎，如肠产毒性大肠杆菌、肠侵袭性大肠杆菌等。肠产毒性大肠杆菌主要通过污染的食物和水传播，细菌产生的毒素会导致肠道分泌增加，引起腹泻；肠侵袭性大肠杆菌则是侵入肠道黏膜上皮细胞并繁殖，引起炎症反应，导致腹痛、腹泻等症状，粪便多为黏液脓血便。
2.沙门氏菌：常通过食用被污染的禽肉、蛋类、肉类等传播。沙门氏菌感染人体后，在肠道内生长繁殖，可引起肠道炎症，患者出现发热、腹痛、腹泻、恶心、呕吐等肠胃炎表现，其腹泻多为水样便或黏液便。
3.志贺氏菌：是细菌性痢疾的病原菌，也可引起肠胃炎。志贺氏菌产生的志贺毒素会损伤肠道黏膜，导致肠道炎症、溃疡，患者主要症状为腹痛、腹泻、黏液脓血便，同时伴有发热等全身症状。
（三）寄生虫感染
1.蓝氏贾第鞭毛虫：主要通过饮用被污染的水感染。寄生虫在小肠内寄生，可引起肠道黏膜炎症，导致患者出现腹泻、腹痛、腹胀、恶心、呕吐等肠胃炎症状，粪便多为稀薄、带有泡沫和恶臭的大便。
2.溶组织内阿米巴：可通过污染的食物或水传播。阿米巴滋养体侵入肠道黏膜，引起组织坏死和溃疡，患者表现为腹痛、腹泻，粪便多为暗红色果酱样，有特殊腥臭味，同时可能伴有发热等全身症状。
二、非感染因素
（一）饮食因素
1.食物过敏：某些人对特定食物过敏，如对牛奶中的蛋白质、海鲜中的某些成分过敏等。当食用过敏食物后，免疫系统会对食物中的过敏原产生过度反应，累及胃肠道时，就会出现肠胃炎症状，如腹痛、腹泻、呕吐、皮肤瘙痒等，婴幼儿由于消化系统和免疫系统发育尚未完善，更容易发生食物过敏相关的肠胃炎。
2.饮食不规律或不洁：长期暴饮暴食、饥饱无常，或者食用了变质、受污染的食物，都可能刺激胃肠道，引起胃肠道功能紊乱，导致肠胃炎。例如，食用了被细菌、毒素污染的食物，即使量不多，也可能引发胃肠道炎症反应，出现腹痛、腹泻等症状。
（二）药物因素
1.非甾体类抗炎药：如阿司匹林、布洛芬等。这类药物长期或大量使用时，会抑制胃黏膜前列腺素的合成，削弱胃黏膜的保护屏障，导致胃黏膜损伤，引起肠胃炎症状，如胃痛、恶心、呕吐、甚至消化道出血等，老年人由于本身胃肠道功能相对较弱，且可能同时患有多种疾病需要长期服用此类药物，发生药物性肠胃炎的风险相对较高。
2.抗生素：广谱抗生素的长期使用可能会破坏肠道正常菌群的平衡，导致肠道菌群失调。例如，长期使用广谱抗生素后，肠道内有益菌大量减少，而条件致病菌如艰难梭菌等可能大量繁殖，从而引起肠道炎症，出现腹泻、腹痛等肠胃炎表现，儿童在使用抗生素时，由于肠道菌群尚未完全建立，更易受到影响。
（三）其他因素
1.腹部着凉：寒冷刺激可导致胃肠道血管收缩，影响胃肠道的血液循环和正常功能，引起胃肠道痉挛，出现腹痛、腹泻等肠胃炎症状，尤其是儿童，由于皮下脂肪薄，体温调节能力较差，腹部更容易着凉而引发肠胃炎。
2.应激状态：当人体处于严重的应激状态时，如重大手术、严重创伤、大面积烧伤等，机体的神经内分泌系统会发生变化，影响胃肠道的蠕动、分泌等功能，导致胃肠道功能紊乱，引发肠胃炎，患者可能出现食欲不振、恶心、呕吐、腹泻等症状，这类患者的病情往往较为复杂，需要综合治疗。
