小儿心肌炎的引发因素包括病毒感染（常见肠道病毒等，经消化道或呼吸道侵入再到心肌）、自身免疫反应（病毒感染致机体产自身抗体攻击心肌，小儿自身免疫调节不完善易异常）、其他因素（药物和毒素可致心肌炎症，少数与遗传有关，一些全身性疾病如川崎病可并发）。
感染途径：病毒主要通过消化道或呼吸道侵入人体，然后经血液循环到达心肌。比如，患儿通过接触被病毒污染的物品后，经口感染肠道病毒，病毒在肠道繁殖后，可通过血液运输到心肌组织。
自身免疫反应
发病机制：当病毒感染人体后，机体的免疫系统会被激活，产生自身抗体。这些自身抗体可能会错误地攻击心肌组织，引发自身免疫性炎症。例如，病毒感染后，机体产生的抗体与心肌细胞表面的某些抗原结合，激活补体系统，导致心肌细胞的损伤和炎症。
影响因素：小儿自身免疫调节功能尚不完善，在病毒感染等因素刺激下，更容易出现自身免疫反应异常。比如婴幼儿时期，免疫系统发育还不成熟，对病毒感染的应对能力相对较弱，更易引发过度的自身免疫反应损伤心肌。
其他因素
药物和毒素：某些药物如抗肿瘤药物、抗生素等可能对心肌有一定毒性，长期或不当使用可能引发心肌炎症。另外，一些毒素如白喉毒素等也可导致心肌损伤，引发心肌炎。例如，个别患儿因患其他疾病使用了具有心肌毒性的药物，在用药过程中出现了心肌炎症的表现。
遗传因素：少数小儿心肌炎可能与遗传因素有关。某些遗传缺陷可能使小儿更容易发生心肌炎症反应。不过，遗传因素导致小儿心肌炎的具体机制还在进一步研究中，相对病毒感染等因素，遗传因素引发小儿心肌炎的比例相对较低。
其他疾病影响：一些全身性疾病，如川崎病等，在病程中可能并发心肌炎。川崎病是一种以全身血管炎为主要病变的小儿疾病，可累及心血管系统，其中就包括引发心肌的炎症病变。小儿患有川崎病时，若没有得到及时有效的治疗，就可能出现心肌炎的并发症。
