肺部真菌感染有多种症状表现，呼吸系统症状包括刺激性干咳或伴少量白痰等、咳痰性状多样、病情重时出现呼吸困难、部分患者有胸痛；全身症状有多数患者发热及全身乏力；免疫力低下人群感染可能严重且进展快，儿童感染还可能出现生长发育迟缓等特殊情况。
咳嗽：可为刺激性干咳，也可伴有少量白痰或黏痰，部分患者咳嗽较为剧烈，持续时间较长，不同年龄、生活方式及病史的患者表现可能有所差异。例如，免疫力低下的老年人可能因咳嗽无力，痰液不易咳出；长期吸烟的肺部真菌感染患者，咳嗽症状可能相对更明显且持续存在。
咳痰：痰液性状多样，可为白色黏液痰，若合并细菌感染，可能变为黄色脓性痰。对于儿童肺部真菌感染患者，咳痰相对困难，可能表现为喉咙有痰响、呼吸时伴有痰鸣音等。
呼吸困难：病情较重时可出现，主要是由于肺部组织受真菌侵犯，影响气体交换功能所致。不同年龄段人群表现有别，儿童可能表现为呼吸急促、鼻翼扇动等；老年人可能在活动后明显感到气促，休息时相对缓解，但随着病情进展，静息状态下也可能出现呼吸困难。
胸痛：部分患者可出现胸痛症状，多为隐痛或刺痛，疼痛程度不一，与病变累及胸膜等组织有关。
全身症状
发热：多数患者有发热表现，体温可呈不同程度升高，可为低热（体温37.3-38℃），也可为中热（体温38.1-39℃）或高热（体温≥39℃）。不同人群发热特点有差异，儿童免疫系统发育不完善，肺部真菌感染时发热可能较为常见且体温波动相对较大；老年人由于机体反应性较低，发热可能不典型，体温升高幅度可能不如年轻人明显。
乏力：患者常感到全身疲倦、没有力气，活动耐力下降。这是因为感染导致机体代谢紊乱，能量消耗增加，同时毒素吸收等因素影响所致。无论是儿童、成年人还是老年人，都可能出现乏力症状，且随着病情变化，乏力程度可能有所不同。
其他表现
免疫力低下人群的特殊表现：对于患有基础疾病如艾滋病、恶性肿瘤等导致免疫力低下的患者，肺部真菌感染可能较为严重，症状可能不典型且进展迅速。例如艾滋病患者肺部真菌感染时，除了上述呼吸系统和全身症状外，可能很快出现呼吸衰竭等严重并发症，病情凶险。
儿童肺部真菌感染的特殊情况：儿童肺部真菌感染除了上述一般症状外，还可能出现生长发育迟缓等情况，因为肺部感染影响了营养物质的吸收和氧气供应，从而对儿童的生长发育产生不利影响。
