输卵管妊娠的常见病因包括输卵管病变（如输卵管炎症、输卵管手术史）、受精卵游走、输卵管发育不良或功能异常、辅助生殖技术以及其他因素（如子宫肌瘤或卵巢肿瘤压迫、子宫内膜异位症），有过输卵管相关手术史、盆腔炎性疾病病史及接受辅助生殖技术的女性是高危人群。
输卵管病变
输卵管炎症：是输卵管妊娠的主要病因。包括输卵管黏膜炎和输卵管周围炎。输卵管黏膜炎轻者可使黏膜皱褶粘连，管腔变窄，或使纤毛功能受损，从而导致受精卵在输卵管内运行受阻而于该处着床；输卵管周围炎主要病变在输卵管的浆膜层或浆肌层，常造成输卵管周围粘连，输卵管扭曲，管腔狭窄，管壁肌蠕动减弱，影响受精卵的运行。盆腔炎性疾病既往史，尤其是有过输卵管炎的患者，发生输卵管妊娠的可能性较大。例如，有研究表明，盆腔炎性疾病患者输卵管妊娠的发生率比无盆腔炎性疾病者高10-20倍。
输卵管手术史：曾行输卵管绝育术、输卵管复通术或输卵管成形术等，若术后输卵管恢复不佳，出现管腔狭窄、通畅度异常等情况，受精卵着床于输卵管的风险增加。比如，输卵管绝育术后若发生再通，或者输卵管成形术后，输卵管的结构和功能可能受到影响，导致受精卵运行受阻而发生输卵管妊娠。
受精卵游走：卵子在一侧输卵管受精，受精卵经宫腔或腹腔进入对侧输卵管，称受精卵游走。由于受精卵移行时间过长，发育增大，即可在对侧输卵管内着床形成输卵管妊娠。
输卵管发育不良或功能异常：输卵管过长、肌层发育差、黏膜纤毛缺乏、双输卵管、输卵管憩室或有副伞等，均可造成输卵管妊娠。此外，内分泌失调、精神紧张等因素可引起输卵管功能异常，影响受精卵的正常运行。例如，内分泌紊乱时，输卵管的蠕动可能出现异常，导致受精卵不能正常输送至宫腔而在输卵管内着床。
辅助生殖技术：随着辅助生殖技术的应用，输卵管妊娠的发生率有所增加。这与胚胎移植技术、受精卵的质量以及输卵管的功能等多种因素有关。例如，接受体外受精-胚胎移植（IVF-ET）的患者，输卵管妊娠的发生率约为3%左右，明显高于自然妊娠的发生率。
其他：子宫肌瘤或卵巢肿瘤压迫输卵管，影响输卵管管腔通畅，使受精卵运行受阻。子宫内膜异位症可增加输卵管妊娠的可能性，可能是因为异位的内膜组织可影响输卵管的正常结构和功能。特殊人群方面，比如有过输卵管相关手术史的女性、有盆腔炎性疾病病史的女性以及接受辅助生殖技术的女性等属于输卵管妊娠的高危人群，这些人群需要更加密切地进行孕前和孕期监测，以便早期发现输卵管妊娠并采取相应措施。
