膝关节滑膜褶襞综合征的病因包括先天性因素和后天性因素，先天性因素是胚胎发育异常致滑膜皱襞结构形态异常，后天性因素有过度运动使滑膜皱襞反复摩擦挤压及创伤（急性或慢性累积性）致滑膜皱襞损伤或慢性炎症。
胚胎发育异常：在胚胎发育过程中，膝关节滑膜皱襞的形成出现异常。正常胚胎发育时，滑膜皱襞会有一定的形成、退化过程，如果这个过程发生紊乱，就可能导致滑膜皱襞结构和形态异常，进而引发膝关节滑膜褶襞综合征。例如，某些基因的异常表达可能干扰滑膜皱襞的正常发育，使得滑膜皱襞不能按正常的方式退化，残留异常的滑膜皱襞组织，在膝关节活动时受到刺激而发病。这种先天性因素在儿童和青少年中也可能存在，因为儿童的膝关节仍处于生长发育阶段，胚胎发育异常的影响可能持续到生长发育时期。对于儿童患者，由于其膝关节的生长发育特点，先天性因素导致的滑膜皱襞异常更易引发症状，需要密切关注其膝关节发育情况。
后天性因素
过度运动：长期、过度的膝关节运动是常见的后天性致病因素。比如运动员、舞蹈演员等长期进行膝关节屈伸、扭转等剧烈运动的人群。过度运动使得膝关节滑膜皱襞反复受到摩擦、挤压。以跑步为例，在跑步过程中，膝关节不断地屈伸，滑膜皱襞会与膝关节内的其他结构如软骨、半月板等反复摩擦，长期如此就会导致滑膜皱襞出现充血、水肿、增生等病理改变，进而引发膝关节滑膜褶襞综合征。对于运动爱好者来说，如果运动强度过大、运动方式不当，都可能增加患病风险。不同年龄、性别的人群在运动时都可能出现这种情况，但相对而言，年轻人由于活动量较大、运动强度可能更高，更容易因过度运动导致该病症。例如年轻男性运动员，在进行高强度训练时，如果膝关节的运动姿势不正确，滑膜皱襞受到的应力集中，就更容易发病。
创伤：膝关节的急性创伤或慢性累积性创伤都可能引起膝关节滑膜褶襞综合征。急性创伤如膝关节的扭伤、撞伤等，可能直接导致滑膜皱襞的损伤，引发炎症反应。慢性累积性创伤则是由于长期的轻微损伤不断积累，使得滑膜皱襞逐渐出现病变。比如膝关节多次轻微的扭伤，虽然每次损伤都不严重，但反复的损伤会导致滑膜皱襞反复受到刺激，引起滑膜皱襞的慢性炎症，最终发展为膝关节滑膜褶襞综合征。对于有膝关节创伤史的人群，无论是急性还是慢性创伤，都需要更加关注膝关节的健康状况。不同年龄的人群都可能遭受创伤，老年人由于膝关节退变，本身关节稳定性下降，更容易在轻微创伤下引发滑膜皱襞的问题；而儿童如果有膝关节的外伤，也可能影响滑膜皱襞的正常结构和功能。女性在一些活动中可能因姿势等原因更容易发生膝关节创伤，从而增加患病几率。
