儿童肺炎的病原体包括细菌、病毒、支原体等，不同病原体有不同特点，如肺炎链球菌是儿童肺炎常见细菌病原体，呼吸道合胞病毒是婴幼儿肺炎重要病毒病原体，肺炎支原体多见于5岁以上儿童近年婴幼儿感染率上升，新生儿及有基础疾病儿童患肺炎需重视。
金黄色葡萄球菌：多见于1岁-5岁的婴幼儿，常由呼吸道入侵或经血行播散至肺部。金黄色葡萄球菌感染引起的肺炎病情往往较为严重，易出现脓胸、脓气胸等并发症。研究显示，金黄色葡萄球菌肺炎在住院儿童肺炎病例中占比约为5%-10%，该菌产生的毒素可导致肺部组织坏死、脓肿形成等。
流感嗜血杆菌：主要侵犯5岁以下儿童，可引起支气管炎、肺炎等。在儿童肺炎病例中，由流感嗜血杆菌引起的约占3%-6%，它可通过飞沫传播，该菌产生的内毒素等可损伤呼吸道黏膜，引发炎症反应。
病毒
呼吸道合胞病毒（RSV）：是婴幼儿肺炎的重要病原体，多见于2岁以下尤其是6个月以内的婴儿。RSV感染可引起细支气管炎和肺炎，在冬季和早春季节高发。大量研究表明，约50%的婴幼儿肺炎是由RSV感染引起，该病毒可直接侵犯肺部组织，导致肺泡和细支气管炎症、黏液分泌增加等，进而影响气体交换。
腺病毒：各年龄均可感染，但以6个月-2岁儿童多见。腺病毒肺炎病情相对较重，热程较长，可引起肺炎、支气管炎等。临床资料显示，腺病毒肺炎在小儿肺炎中占比约为2%-5%，该病毒可在呼吸道上皮细胞内大量繁殖，引起细胞病变，导致肺部炎症反应。
流感病毒：多见于学龄前期及学龄期儿童，可引起流行性感冒并发肺炎。流感病毒感染后，除了有发热、咳嗽等流感样症状外，还易累及肺部，导致肺炎发生。在流感流行季节，约10%-20%的流感患儿可发展为肺炎，流感病毒可通过抗原变异等方式不断引起新的流行，对儿童健康造成威胁。
支原体
肺炎支原体（MP）：多见于5岁以上儿童，但近年来婴幼儿感染率有上升趋势。肺炎支原体感染引起的肺炎起病相对较缓，可表现为发热、咳嗽等，且咳嗽多较为剧烈。研究发现，在儿童肺炎病例中，肺炎支原体感染占比约为10%-20%，肺炎支原体可通过黏附在呼吸道上皮细胞表面，引起免疫反应和炎症损伤，导致肺部出现间质性肺炎等改变。
特殊人群方面，新生儿由于免疫系统发育不完善，感染病原体引起肺炎的情况需格外重视。例如，新生儿感染肺炎链球菌时，症状可能不典型，易被忽视，应密切观察其呼吸、体温等情况；对于有基础疾病的儿童，如先天性心脏病患儿，感染病原体后更易引发肺炎且病情可能较重，因为基础疾病会影响肺部的血液循环和气体交换功能，使机体抵抗力进一步下降，更易受到病原体侵袭。
