腰椎椎管狭窄症的病因包括先天因素（胚胎发育时椎管结构异常致儿童期随生长可能出现症状）、退行性因素（椎间盘退变使椎体边缘骨质增生、黄韧带增厚钙化，小关节退变致关节突增生内聚）、外伤因素（急性腰椎外伤治疗不当致椎管结构改变）、其他因素（医源性因素如手术操作不当、代谢因素如骨质疏松等）。
退行性因素
椎间盘退变：随着年龄的增长，椎间盘会发生退变，髓核水分减少，椎间盘高度降低，椎间隙变窄，椎体间稳定性下降，进而引起椎体边缘骨质增生，黄韧带也会增厚、钙化，这些变化都会导致椎管容积减小，引发腰椎椎管狭窄症。这种情况在中老年人中较为常见，因为随着年龄增加，椎间盘退变是一个自然的生理过程，而女性在绝经后由于雌激素水平下降，骨质疏松等情况可能会加速椎间盘的退变，从而增加患腰椎椎管狭窄症的风险；男性随着年龄增长，也会不可避免地出现椎间盘退变等情况。长期从事重体力劳动、腰部频繁活动的人群，椎间盘退变会加速，比如建筑工人、搬运工人等，他们腰部承受的压力较大，椎间盘受到的磨损更严重，更容易发生退变导致椎管狭窄。
小关节退变：腰椎的小关节也会随着年龄增长发生退变，出现关节突增生、内聚等情况，使得椎管的矢状径和横径减小，影响椎管内容物的空间，引发椎管狭窄。长期不良的姿势，如久坐、弯腰驼背等，会加重小关节的退变，比如一些办公室工作人员，长时间保持久坐的姿势，腰部小关节长期处于不正常的受力状态，容易发生退变，进而增加腰椎椎管狭窄症的发病几率。
外伤因素
急性的腰椎外伤，如严重的腰椎骨折、脱位等，如果治疗不及时或治疗不当，可能会导致椎管内结构的异常改变，使椎管容积减小，引发腰椎椎管狭窄症。例如，高处坠落导致腰椎骨折，骨折碎片可能会突入椎管内，压迫脊髓和神经组织，经过一段时间后，局部可能会出现瘢痕组织增生、骨痂形成等情况，进一步狭窄椎管。青少年时期如果发生过严重的腰椎外伤，即使当时经过治疗，后期也可能因为外伤导致的椎管结构改变而在成年后逐渐出现腰椎椎管狭窄症的症状。
其他因素
医源性因素：一些腰部的手术，如腰椎融合术等，如果手术操作不当，可能会导致椎管内组织的异常增生、瘢痕形成等，从而引起椎管狭窄。例如，在腰椎融合手术中，骨赘的过度生长或者内固定物位置不当等情况，都可能会影响椎管的容积，引发腰椎椎管狭窄症。
代谢因素：骨质疏松等代谢性疾病会影响腰椎的骨质结构，导致椎体骨质增生、椎间隙变窄等，进而引发椎管狭窄。绝经后的女性由于雌激素水平下降，骨质疏松的发生率较高，更容易出现这种情况；一些老年人随着年龄增长，也会出现不同程度的骨质疏松，增加了患腰椎椎管狭窄症的风险。
