输卵管妊娠的发生与多种因素相关，包括输卵管炎症（如输卵管黏膜炎使管腔变窄或堵塞、输卵管周围炎致周围粘连扭曲等）、输卵管手术史（绝育术后复通及整形术后易致管腔不畅或结构功能受影响）、输卵管发育不良或功能异常（过长、肌层发育差等发育不良及内分泌等致功能异常影响受精卵运行）、辅助生殖技术应用、避孕失败（宫内节育器避孕失败及口服紧急避孕药失败时妊娠在输卵管可能性增加）以及其他因素（子宫肌瘤或卵巢肿瘤压迫、既往输卵管妊娠史等增加风险）。
输卵管周围炎：多发生在输卵管的浆膜层或浆肌层，常造成输卵管周围粘连，输卵管扭曲，管腔狭窄，管壁肌蠕动减弱，影响受精卵的运行。如盆腔炎症、阑尾炎等引起的输卵管周围炎，可使输卵管位置发生改变，增加输卵管妊娠的发生风险。
输卵管手术史
输卵管绝育术后复通：输卵管绝育术后若发生复通，可使输卵管腔变得不顺畅，影响受精卵的通过，增加输卵管妊娠的可能性。比如，曾经接受过输卵管结扎术，后来通过复通手术恢复输卵管通畅，但复通后的输卵管可能存在管腔狭窄、蠕动异常等情况，导致受精卵在通过时受阻而着床于输卵管。
输卵管整形术：输卵管整形术后，输卵管的结构和功能可能受到一定影响，如手术部位可能形成瘢痕组织，导致管腔狭窄或蠕动异常，从而增加输卵管妊娠的发生几率。例如，因输卵管堵塞等问题接受过输卵管整形手术的患者，相对更容易出现输卵管妊娠。
输卵管发育不良或功能异常
输卵管发育不良：输卵管过长、肌层发育差、黏膜纤毛缺乏等，均可造成输卵管妊娠。例如，先天性输卵管过长，会使受精卵在输卵管内运行时间延长，增加着床在输卵管的机会。
输卵管功能异常：内分泌失调、神经精神功能紊乱可引起输卵管功能异常，影响受精卵的正常运行。比如，体内激素水平失衡时，可能导致输卵管蠕动节律异常，使受精卵不能正常被输送至子宫腔，而在输卵管内着床。
辅助生殖技术
随着辅助生殖技术的应用，输卵管妊娠的发生率有所增加。这可能与胚胎移植的操作、患者自身的输卵管状况等多种因素有关。例如，在体外受精-胚胎移植过程中，胚胎被移植到宫腔内的过程可能对输卵管产生一定影响，或者患者本身存在潜在的输卵管问题，使得胚胎在输卵管着床的风险增加。
避孕失败
宫内节育器避孕失败：宫内节育器避孕失败时，妊娠发生在输卵管的可能性增加。这是因为宫内节育器可能影响受精卵在输卵管内的运行，导致受精卵着床位置异常。例如，宫内节育器位置下移或失效等情况，会降低其避孕效果，使输卵管妊娠的风险上升。
口服紧急避孕药失败：口服紧急避孕药失败后怀孕，发生输卵管妊娠的几率也会相对较高。紧急避孕药主要是通过干扰排卵、受精或着床过程来达到避孕目的，若避孕失败，受精卵在输卵管着床的可能性增加。
其他因素
子宫肌瘤或卵巢肿瘤压迫：子宫肌瘤或卵巢肿瘤可压迫输卵管，影响输卵管管腔的通畅性，使受精卵运行受阻，从而增加输卵管妊娠的发生风险。例如，较大的子宫肌瘤可能压迫输卵管，导致输卵管管腔狭窄，阻碍受精卵通过。
既往输卵管妊娠史：有过输卵管妊娠史的女性，再次发生输卵管妊娠的可能性比一般人群高。这是因为既往输卵管妊娠可能对输卵管造成了一定的损伤，如输卵管局部的瘢痕形成等，影响了输卵管的正常结构和功能，使得再次妊娠时受精卵更容易在输卵管着床。
