肺脓肿的发生与病原体感染、气道阻塞、机体免疫力低下相关。病原体感染包括需氧菌与兼性厌氧菌、厌氧菌、真菌、寄生虫等感染；气道阻塞有异物阻塞及支气管狭窄或受压；机体免疫力低下涉及糖尿病、艾滋病、COPD等基础疾病影响及长期使用免疫抑制剂、营养不良等因素。
需氧菌与兼性厌氧菌：肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌等是常见的致病需氧菌与兼性厌氧菌。例如金黄色葡萄球菌可通过血行播散等途径引发肺脓肿，在一些研究中发现，金黄色葡萄球菌感染导致肺脓肿的情况较为多见。肺炎链球菌感染后，若机体免疫等因素未能有效清除病原体，可能逐渐发展为肺脓肿。
厌氧菌：口腔中的厌氧菌是引起吸入性肺脓肿的主要病原体，如消化链球菌、梭形杆菌等。由于口腔中的厌氧菌数量较多，当患者存在意识障碍（如醉酒、癫痫发作等导致的意识不清）、吞咽困难等情况时，容易将口腔内含有厌氧菌的分泌物误吸入肺内，从而引发肺脓肿。据统计，吸入性肺脓肿中约有80%-90%是由厌氧菌感染引起。
其他病原体感染：
真菌：在一些免疫力低下的人群中，如长期使用广谱抗生素、糖皮质激素，或患有免疫缺陷性疾病（如艾滋病等）的患者，可能会发生真菌感染导致肺脓肿。例如曲霉菌等真菌可在肺部定植并引起感染，进而形成肺脓肿，但相对细菌感染来说，真菌性肺脓肿的发生率较低。
寄生虫：如肺吸虫等寄生虫感染也可能导致肺脓肿，肺吸虫在人体肺部移行时可破坏肺组织，引起炎症反应，最终形成脓肿，但这种情况相对较为罕见。
气道阻塞
异物阻塞：
儿童是气道异物阻塞导致肺脓肿的高发人群，儿童在玩耍过程中可能将小的玩具、食物等吸入气道，如花生米、小珠子等。异物阻塞气道后，会导致远端肺组织引流不畅，容易继发细菌感染，进而引发肺脓肿。例如有研究报道，因气道异物阻塞导致肺脓肿的患儿中，相当一部分是由于吸入了小的异物后未及时取出，后续出现肺部感染并发展为肺脓肿。
成年人也可能因气道内的肿瘤、较大的异物等导致气道阻塞，如支气管肺癌患者，肿瘤阻塞支气管，使远端肺组织的分泌物无法排出，细菌滋生，从而引发肺脓肿。
支气管狭窄或受压：
肿瘤压迫：肺部或纵隔的肿瘤，如肺癌、纵隔肿瘤等，可压迫支气管，导致气道狭窄，影响肺部的通气和引流。例如肺癌生长过程中逐渐压迫支气管，使远端肺组织的痰液等分泌物积聚，容易继发感染形成肺脓肿。
外部压迫：纵隔淋巴结肿大（如结核性纵隔淋巴结肿大、恶性淋巴瘤导致的纵隔淋巴结肿大等）可压迫支气管，引起气道狭窄，进而影响肺组织的正常引流，增加肺脓肿的发生风险。
机体免疫力低下
基础疾病影响：
糖尿病：糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体的免疫功能受到影响，容易发生各种感染。高血糖环境有利于细菌的生长繁殖，糖尿病患者发生肺脓肿的风险较正常人明显升高。研究发现，糖尿病患者肺脓肿的发生率比非糖尿病患者高出数倍，这是因为高血糖状态下，白细胞的吞噬功能受到抑制，机体的抗感染能力下降。
艾滋病：艾滋病患者由于免疫系统严重受损，CD4+T淋巴细胞计数明显降低，容易遭受各种机会性感染。肺脓肿在艾滋病患者中并不少见，病原体可以是细菌、真菌等多种微生物，由于患者免疫功能极度低下，感染容易扩散和加重。
慢性阻塞性肺疾病（COPD）：COPD患者肺部存在慢性炎症，气道黏膜受损，纤毛运动功能障碍，痰液排出困难，导致肺部易反复感染。长期的肺部炎症状态使得肺组织更容易受到病原体的侵袭，从而增加了肺脓肿的发生几率。例如COPD患者由于气道阻塞，痰液潴留，为细菌的生长提供了良好的环境，容易引发肺脓肿。
其他因素：
长期使用免疫抑制剂：接受器官移植后需要长期使用免疫抑制剂的患者，以及患有自身免疫性疾病长期使用糖皮质激素等免疫抑制剂治疗的患者，机体的免疫功能被抑制，对病原体的抵抗力下降，容易发生肺脓肿。如肾移植患者在使用免疫抑制剂期间，肺部感染的风险增加，其中肺脓肿是较为常见的感染类型之一。
营养不良：营养不良的人群，如长期节食、患有慢性消耗性疾病（如恶性肿瘤等）的患者，机体的营养状况差，蛋白质、维生素等营养物质缺乏，会影响免疫系统的正常功能，导致免疫力低下，容易发生肺脓肿。例如恶性肿瘤患者由于肿瘤的消耗以及抗肿瘤治疗的影响，常出现营养不良，同时合并肺部感染进而发展为肺脓肿的情况较为常见。
