慢性肠胃炎一般较少引起发烧，但急性发作期合并感染或非感染性因素致炎症反应较重时可能发烧，急性发作合并细菌等感染时如肠道受大肠杆菌感染等会因免疫系统激活致发烧，不同人群如儿童、成年人、生活方式不健康者、有基础疾病者情况不同，自身免疫性因素致的慢性肠胃炎炎症重时也可能低热，女性特殊时期患慢性肠胃炎炎症重时相对更易发烧。
急性发作期合并感染：当慢性肠胃炎处于急性发作阶段，并且合并了细菌等病原体感染时，有可能引发发烧。例如，若肠道受到大肠杆菌等致病菌感染，身体的免疫系统被激活，会出现炎症反应，进而可能导致体温升高。不同年龄段人群对此的反应可能有所不同，儿童的免疫系统相对脆弱，在合并感染时更易出现发烧情况，且儿童发烧时需特别关注，因为儿童体温调节中枢尚未发育完善，体温波动可能较快较明显；而成年人相对而言，免疫系统相对成熟些，但也需根据具体感染程度等情况判断。生活方式不健康，如长期酗酒、饮食不规律且经常食用刺激性食物等人群，本身肠胃功能较差，在慢性肠胃炎急性发作合并感染时，也较易出现发烧症状。有慢性肠胃炎病史且伴有其他基础疾病的人群，如糖尿病患者，其身体抵抗力相对较低，在合并感染引发慢性肠胃炎急性发作时，更易出现发烧且病情可能相对复杂。
非感染性因素导致的炎症反应较重：一些非感染性因素引起的慢性肠胃炎炎症反应较重时，也可能出现轻度发烧。比如自身免疫性因素导致的慢性肠胃炎，身体的自身免疫反应较为强烈，也可能引发机体的体温调节紊乱，出现低热情况。不同性别在这方面并没有本质差异，但女性在生理期等特殊时期，身体抵抗力可能会有一定波动，若此时患有慢性肠胃炎，在炎症反应较重时相对更易出现发烧等情况。
