扁平疣部分患者可自愈，其自愈受年龄、自身免疫力、数量和严重程度影响，时间不确定，若不能等待自愈可采取物理、药物等治疗措施，特殊人群治疗需谨慎。
一、影响自愈的因素
年龄方面：儿童和青少年相对成人可能有一定的自愈倾向。这是因为儿童的免疫系统处于不断发育完善的过程中，对于病毒的清除能力可能相对较强。例如，一些研究发现，部分儿童患者的扁平疣在未进行特殊治疗的情况下，随着年龄增长，免疫系统逐渐成熟，病毒被清除，扁平疣自行消退。而成年人的免疫系统相对稳定，扁平疣自愈的概率相对儿童可能较低。
自身免疫力：免疫力较强的人相对更容易实现扁平疣自愈。比如经常进行体育锻炼、作息规律、营养状况良好的人，其身体的免疫系统能够更好地识别和清除HPV病毒。相反，免疫力低下的人群，如患有某些慢性疾病（像糖尿病等）、长期使用免疫抑制剂的人，扁平疣自愈的可能性较小。
扁平疣的数量和严重程度：数量较少、皮疹较轻的扁平疣比数量多、皮疹严重的更有可能自愈。如果扁平疣数量多且分布广泛，自愈的难度较大。
二、自愈的时间
扁平疣自愈的时间不确定，短则数月，长则数年。有些患者可能在感染后6-12个月内自行消退，但也有部分患者的扁平疣会持续数年不愈。
三、不能等待自愈时的干预措施
如果扁平疣长时间不愈或者患者觉得影响美观等，可以采取一些治疗措施。例如物理治疗，包括冷冻治疗，通过低温使疣体坏死脱落；激光治疗，利用激光的能量破坏疣体；还有药物治疗，如外用维A酸类药物等，但药物使用需要在医生指导下进行。对于特殊人群，如孕妇，由于身体状况特殊，治疗需要更加谨慎，一般会优先考虑对胎儿影响较小的治疗方式；儿童患者进行治疗时要更加小心，避免造成不必要的创伤和心理影响。
