食管念珠菌感染有多种表现，包括吞咽困难（不同年龄段表现不同，基础疾病患者症状更严重持久）、胸骨后疼痛（疼痛性质多样，不同人群表现有别需鉴别）、口腔念珠菌感染相关表现（常与食管感染同时存在，婴幼儿需注意相关护理）、部分患者有全身症状（免疫缺陷人群全身症状更突出）。
胸骨后疼痛
部分患者会出现胸骨后疼痛的症状。疼痛的性质多为烧灼样或刺痛样，疼痛程度因人而异。当进食时，食物通过病变的食管部位，会刺激炎症部位，从而引发疼痛。对于老年人来说，由于其对疼痛的感知和表述可能不如年轻人准确，可能需要更仔细地观察其进食时的表现以及是否有异常的躯体反应来判断是否存在胸骨后疼痛。而对于长期吸烟、饮酒的人群，其食管黏膜本身可能已经存在一定程度的损伤，发生食管念珠菌感染时，胸骨后疼痛的症状可能会更加明显，且需要与其他原因引起的胸骨后疼痛相鉴别，如冠心病等。
口腔念珠菌感染相关表现
食管念珠菌感染常常与口腔念珠菌感染同时存在，所以患者可能会有口腔念珠菌感染的相关表现，如口腔内出现白色伪膜，擦拭伪膜后可见糜烂面，同时可能伴有口腔疼痛、口干等症状。对于婴幼儿，由于其口腔卫生状况相对较差，且免疫系统尚未完全发育成熟，更容易发生口腔念珠菌感染，进而可能引发食管念珠菌感染，此时需要特别注意婴幼儿的口腔清洁以及喂养器具的消毒等，以预防感染的进一步发展。
全身症状
部分患者可能会出现一些全身症状，如低热、乏力等。这是因为机体受到念珠菌感染后，免疫系统被激活，会产生一系列的免疫反应，从而导致体温轻度升高以及全身乏力的感觉。对于患有免疫缺陷性疾病的人群，如艾滋病患者，由于其免疫系统严重受损，发生食管念珠菌感染时，全身症状可能会更为突出，除了低热、乏力外，还可能伴有体重明显下降等情况，需要及时进行针对性的治疗来控制感染，改善全身状况。
