乙肝由HBV引起，通过血液等传播，部分慢性化，儿童感染慢性化概率高，成人多数可清病毒，诊断靠乙肝五项等，治疗用核苷等药物；丙肝由HCV引起，主要血液传播，更易慢性化，急性丙肝约50%-85%转慢性，诊断靠丙肝抗体等，治疗DAA效果好治愈率高，不能简单说哪个更严重，需综合多因素及个体差异评估。
病情进展与预后方面
乙肝：部分乙肝患者可慢性化，慢性乙肝患者中约有10%-20%可能在若干年后发展为肝硬化、肝癌等严重后果。乙肝的慢性化进程相对较缓，但一旦进展到肝硬化或肝癌，预后较差。不同年龄阶段人群感染乙肝后的转归有差异，儿童时期感染乙肝，慢性化概率较高，而成人感染乙肝多数可清除病毒。
丙肝：丙肝更容易慢性化，约有50%-85%的急性丙肝患者会发展为慢性丙肝。慢性丙肝患者在感染后20年左右，发展为肝硬化的概率约为10%-15%，发展为肝癌的风险也随着病情的迁延而增加。相比乙肝，丙肝的慢性化速度相对较快，从感染到出现严重肝病的时间可能更短。
诊断与治疗手段差异
诊断：乙肝主要通过检测乙肝五项（乙肝表面抗原、乙肝表面抗体、乙肝e抗原、乙肝e抗体、乙肝核心抗体）以及乙肝病毒DNA定量等进行诊断；丙肝则主要检测丙肝抗体、丙肝病毒RNA定量等。
治疗：乙肝的抗病毒治疗药物主要有核苷（酸）类似物（如恩替卡韦等）和干扰素类药物；丙肝的抗病毒治疗已取得重大进展，直接抗病毒药物（DAA）可有效清除病毒，治愈率较高，一般疗程相对较短，例如部分基因型的丙肝患者使用DAA治疗的治愈率可达90%以上。
总体而言，不能简单地绝对说乙肝和丙肝哪个更严重，两者的严重程度都与病情是否得到有效控制等多种因素相关。如果乙肝患者能有效控制病毒复制，病情可长期相对稳定；而丙肝若能及时发现并通过有效的抗病毒治疗，多数可治愈，预后较好，但乙肝在人群中的感染基数大，且部分乙肝患者最终会进展到严重肝病，所以需要综合多方面因素来评估，并且不同个体因年龄、基础健康状况等不同，病情的发展和预后也会有差异。比如儿童乙肝患者需密切监测病情发展，成人丙肝患者若及时接受DAA治疗可显著改善预后。
