扁平疣与尖锐湿疣在病原体、临床表现、好发部位、治疗及特殊人群注意事项上有不同特点，扁平疣由HPV-3、HPV-5等型引起，好发于青少年暴露部位，可外用药物、物理治疗；尖锐湿疣由HPV-6、HPV-11等型引起，性接触为主要传播途径，好发于性活跃中青年生殖器及肛周等部位，治疗方法多且易复发，儿童、孕妇、免疫功能低下人群有不同注意事项。
尖锐湿疣：也是由人乳头瘤病毒引起，主要是HPV-6、HPV-11等型，性接触是主要传播途径，此外还可通过母婴传播等。
临床表现方面
扁平疣：好发于青少年，多发生在颜面、手背及前臂等部位。皮疹一般为米粒至黄豆大小的扁平隆起性丘疹，圆形或椭圆形，表面光滑，质地较硬，正常皮色或淡褐色，数目较多且密集，可因搔抓而呈线状排列（同形反应）。
尖锐湿疣：好发于性活跃的中青年，多见于生殖器及肛周等部位。初起为细小淡红色丘疹，后逐渐增大增多，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状等不同形态，表面凹凸不平，质地柔软，易出血。
好发部位方面
扁平疣：主要集中在面部、手背等暴露部位。
尖锐湿疣：男性多见于龟头、冠状沟、包皮系带、尿道口、阴茎部等；女性多见于大小阴唇、阴道口、阴蒂、阴道、宫颈、会阴及肛门周围等。
治疗方面
扁平疣：可采用外用药物治疗，如维A酸类药物等，也可通过冷冻、激光等物理治疗方法去除。
尖锐湿疣：治疗方法较多，包括局部药物治疗（如鬼臼毒素等）、物理治疗（如激光、冷冻、电灼等）、手术治疗等，由于其易复发，治疗后需要定期复诊。
特殊人群注意事项
儿童：对于儿童扁平疣患者，由于其皮肤较为娇嫩，在选择治疗方法时需更加谨慎，优先考虑对皮肤损伤小的方法，同时要注意避免搔抓，防止自身接种传播。对于儿童尖锐湿疣，多与母婴传播等有关，需要及时就医，由专业医生根据具体情况制定合适的治疗方案，且要注意保护儿童隐私。
孕妇：扁平疣一般对孕妇影响相对较小，但尖锐湿疣孕妇需要特别重视，因为可能会在分娩时传染给胎儿，治疗时要权衡对胎儿的影响，选择相对安全的治疗方式。
免疫功能低下人群：扁平疣和尖锐湿疣在免疫功能低下人群中可能更容易发生且病情较重，如艾滋病患者等，这类人群需要积极治疗基础疾病，增强免疫力，同时规范治疗皮肤病变。
