新生儿阴茎短小可能由遗传因素、内分泌因素、胎儿发育时期母体及环境因素、早产因素等导致，发现后家长应及时带孩子就医检查，进行详细评估并在医生指导下处理，同时关注孩子整体生长发育，定期监测健康。
内分泌因素
促性腺激素缺乏：
下丘脑-垂体-性腺轴功能异常可导致促性腺激素分泌不足。例如，促黄体生成素（LH）和促卵泡生成素（FSH）分泌减少，会影响睾丸的发育和雄激素的分泌。雄激素对于男性生殖器官的正常发育至关重要，缺乏雄激素会使阴茎发育受阻，出现短小的情况。这种内分泌异常可能是先天性的，也可能是由于下丘脑或垂体的病变等原因引起。
雄激素合成或作用异常：
睾丸自身存在问题时，如雄激素合成过程中相关酶缺乏，会导致雄激素合成障碍。例如，5α-还原酶缺乏症，会使睾酮不能正常转化为二氢睾酮，而二氢睾酮是促进阴茎发育的关键雄激素，进而引起阴茎短小。另外，雄激素受体异常也会导致雄激素不能发挥正常的作用，影响阴茎的发育。
胎儿发育时期的影响
母体因素：
在胎儿发育的关键时期，若母亲患有某些疾病，如糖尿病，高血糖环境可能会影响胎儿的内分泌环境，进而影响生殖器官的发育。母亲在孕期服用某些不当药物，也可能干扰胎儿生殖系统的正常发育过程，导致新生儿阴茎短小。此外，母亲孕期的营养状况也很重要，严重营养不良可能会影响胎儿的整体生长发育，包括生殖器官的发育。
环境因素：
胎儿在子宫内暴露于某些不良环境因素中，如接触放射性物质、某些化学污染物等，可能会干扰生殖系统的正常发育程序，导致阴茎发育异常短小。这些环境因素可能通过影响基因表达、细胞分化等过程，对胎儿的生殖器官发育产生负面影响。
其他因素
早产因素：
早产儿由于在母体内发育的时间不足，各器官系统的发育相对不成熟，包括生殖器官。其生殖内分泌系统的发育可能滞后于足月儿，从而影响阴茎的正常发育，导致阴茎短小的发生率相对较高。早产儿出生后需要经历一个追赶生长的过程，但生殖器官的发育追赶可能不完全，也会在一定程度上导致阴茎短小的情况存在。
对于发现新生儿阴茎短小的情况，家长应及时带孩子就医，进行详细的检查，包括内分泌检查（如性激素水平测定、促性腺激素测定等）、染色体检查等，以明确具体原因，并在医生的指导下进行相应的评估和后续处理。同时，要关注新生儿的整体生长发育情况，定期进行健康监测，确保孩子能够得到及时、恰当的医疗干预和生长发育支持。
