胃窦炎的病因包括幽门螺杆菌感染（幽门螺杆菌在胃窦部定植破坏胃黏膜防御屏障引发炎症，不同人群感染概率有差异）、药物因素（长期服非甾体抗炎药致胃黏膜防御功能下降，不同年龄性别风险有别）、不良饮食习惯（长期暴饮暴食等损伤胃窦黏膜，不同生活方式人群发病风险不同）、十二指肠-胃反流（内容物反流损伤胃窦黏膜，年龄增长、有胃部手术史者易发生）、自身免疫因素（自身免疫性胃炎患者体内抗体致胃窦黏膜免疫炎症反应，不同年龄性别发病情况有差异）。
药物因素
长期服用非甾体抗炎药（如阿司匹林、布洛芬等）是导致胃窦炎的另一重要病因。非甾体抗炎药可通过抑制环氧合酶（COX）的活性，减少前列腺素的合成，而前列腺素对胃黏膜有保护作用，其减少会使胃黏膜的防御功能下降，易受到胃酸和胃蛋白酶的侵蚀，从而引发胃窦部炎症。不同年龄人群对非甾体抗炎药的耐受性不同，老年人由于肝肾功能减退，药物代谢能力下降，服用非甾体抗炎药后发生胃窦炎的风险可能更高；女性在某些生理阶段，如月经期间，对非甾体抗炎药相关胃黏膜损伤的易感性可能也会有所不同。
不良饮食习惯
长期暴饮暴食、喜食辛辣刺激性食物、过度饮酒等不良饮食习惯可损伤胃窦黏膜。辛辣刺激性食物会直接刺激胃窦黏膜，引起黏膜充血、水肿等炎症反应；过度饮酒会导致胃黏膜血管收缩，影响胃黏膜的血液供应，同时酒精及其代谢产物可直接损伤胃黏膜上皮细胞，破坏胃黏膜屏障，引发胃窦炎。不同生活方式的人群，如长期熬夜、工作压力大的人群，可能更易出现不良饮食习惯，从而增加胃窦炎的发病风险；男性相对女性可能更易有过度饮酒等不良习惯，进而影响胃窦健康。
十二指肠-胃反流
十二指肠内容物（如胆汁、胰液等）反流至胃内，其中的胆盐、胰酶等物质可损伤胃窦黏膜，引发炎症。当幽门括约肌功能失调或胃排空延迟时，更容易发生十二指肠-胃反流。年龄增长可能会导致幽门括约肌功能减退，增加十二指肠-胃反流的发生概率；有胃部手术史的人群，如胃大部切除术患者，也易出现十二指肠-胃反流，进而引发胃窦炎。
自身免疫因素
自身免疫性因素也可导致胃窦炎，多见于自身免疫性胃炎患者，患者体内存在针对壁细胞或内因子的自身抗体，导致壁细胞受损，胃酸分泌减少，进而引起胃窦部黏膜的一系列免疫炎症反应。自身免疫性胃窦炎在不同年龄、性别中的发病情况有所不同，一般在中老年人群中相对多见，女性发病率可能略高于男性，但具体机制仍需进一步深入研究。
