脸上长扁平疣主要有以下原因：人乳头瘤病毒（HPV）感染，主要是HPV-3、HPV-5等型别，皮肤黏膜有微小破损时HPV易侵入增殖致皮肤出现赘生物；自身免疫力因素，儿童青少年免疫系统未完全发育、免疫力低易发病，免疫力低下人群如患免疫缺陷病、长期用免疫抑制剂者也易感染；皮肤接触传播，包括直接接触患者或间接接触被污染物品；皮肤屏障功能受损，皮肤受外伤、搔抓等损伤或长期熬夜等不良生活方式致屏障功能下降，易让HPV侵入引发扁平疣。
扁平疣是由人乳头瘤病毒感染引起的，其中主要是HPV-3、HPV-5等型别。当皮肤黏膜有微小破损时，HPV就容易侵入上皮细胞内，进而增殖、复制，导致上皮细胞异常分化和增生，从而引起皮肤良性赘生物的形成，使脸上出现扁平疣。例如，有研究发现，扁平疣患者皮肤中可检测到特定型别的HPV病毒核酸。
自身免疫力因素
儿童和青少年：儿童和青少年的免疫系统相对尚未完全发育成熟，免疫力相对较低，更容易感染HPV并患上扁平疣。比如，一些处于生长发育阶段的青少年，由于身体免疫系统功能还在完善过程中，当接触到HPV后，就较易发病。
免疫力低下人群：患有某些疾病（如艾滋病等免疫缺陷性疾病）、长期使用免疫抑制剂等导致免疫力低下的人群，其身体抵御HPV感染的能力减弱，也更容易感染HPV引发扁平疣。例如，艾滋病患者由于免疫系统被严重破坏，感染HPV后发生扁平疣等相关病变的几率会显著增加。
皮肤接触传播因素
直接接触：与扁平疣患者直接接触，如和患者握手、共用毛巾等个人物品等，都可能导致HPV的传播。因为扁平疣患者皮肤表面存在病毒，接触过程中病毒可通过皮肤的微小破损处进入健康人的皮肤，从而引发感染。
间接接触：接触被HPV污染的物品，如公共浴室的毛巾、拖鞋等，也有可能感染HPV。虽然HPV在外界环境中的存活能力有限，但在适宜的条件下，仍可能通过间接接触传播到脸上，引起扁平疣。
皮肤屏障功能受损因素
皮肤损伤：脸上皮肤如果受到外伤、搔抓等导致皮肤屏障功能受损，就为HPV的侵入提供了便利条件。例如，脸上皮肤被抓伤后，皮肤的完整性被破坏，此时HPV更容易感染皮肤细胞，进而引发扁平疣。
不良生活方式影响：长期熬夜、过度疲劳等不良生活方式会影响皮肤的正常代谢和免疫功能，使皮肤屏障功能下降，增加感染HPV长扁平疣的风险。比如，长期熬夜会打乱人体的生物钟，影响皮肤细胞的修复和更新，降低皮肤的抵抗力，容易让HPV趁虚而入。
