霉菌性食管炎有典型症状和其他伴随症状，典型症状包括吞咽困难（因食管黏膜受霉菌侵袭致充血水肿、管腔狭窄）和胸骨后疼痛（食物刺激受损黏膜引发，老年患者表现可能不典型）；其他伴随症状有反酸、烧心（食管下括约肌功能受影响，不良饮食习惯等会加重）、呕吐（食管梗阻加重致胃内容物反流）、体重减轻（进食量减少致营养摄入不足）、少数患者出现消化道出血（霉菌感染致食管黏膜糜烂溃疡侵犯血管）。
吞咽困难：这是霉菌性食管炎较为常见的症状。患者在进食固体或流质食物时，会感觉食物通过食管不顺畅，有阻滞感。其发生机制主要是由于食管黏膜受到霉菌侵袭，引发炎症反应，导致食管黏膜充血、水肿，管腔狭窄，从而影响食物的通过。例如，一些免疫功能低下的患者，如长期使用广谱抗生素、接受化疗或患有艾滋病等的人群，更容易出现吞咽困难的情况，且随着病情进展，吞咽困难可能会逐渐加重。
胸骨后疼痛：疼痛性质多为烧灼样、刺痛或隐痛，疼痛可放射至背部、颈部等部位。当食物通过食管时，会刺激受损的食管黏膜，引起疼痛。不同年龄段的患者都可能出现胸骨后疼痛，但在老年患者中可能由于其痛觉敏感度相对较低，疼痛表现可能不典型。比如老年患者可能仅表现为胸部的不适感，容易被忽视，从而延误病情。
其他伴随症状
反酸、烧心：这是由于食管下括约肌功能受到影响，胃酸反流至食管引起的。霉菌感染导致食管黏膜屏障功能受损，使得胃酸更容易反流。在生活方式方面，如果患者本身有不良的饮食习惯，如进食过饱、食用过多辛辣刺激性食物等，会加重反酸、烧心的症状。对于女性患者，在孕期由于激素水平变化，可能会使食管下括约肌松弛，增加反酸、烧心的发生风险。
呕吐：病情较重时可能出现呕吐症状，呕吐物可为胃内容物，严重者可能含有少量血液。这是因为食管梗阻加重，胃内容物无法顺利通过食管进入肠道，从而导致反流呕吐。儿童患者如果发生霉菌性食管炎出现呕吐，需要特别注意其营养状况，因为频繁呕吐可能会导致营养不良，影响生长发育。
体重减轻：由于吞咽困难导致进食量减少，营养摄入不足，患者可能会出现体重逐渐减轻的情况。无论是儿童还是成人，体重减轻都是需要关注的重要表现。对于儿童来说，体重不增或减轻可能会影响其正常的生长曲线；成人则可能出现体力下降、精神萎靡等表现。
消化道出血：少数患者可能出现消化道出血，表现为黑便或呕血。这是因为霉菌感染导致食管黏膜糜烂、溃疡，侵犯到血管引起出血。老年患者合并有心血管疾病等基础疾病时，消化道出血可能会诱发心脑血管意外，需要格外警惕。例如老年患者本身有高血压病史，发生消化道出血时，血压波动可能会较大，增加脑出血等并发症的风险。
