结肠炎有消化系统症状如腹泻、腹痛、黏液便或脓血便，全身症状如发热、乏力消瘦，还有其他系统症状如关节、皮肤、眼部表现，不同年龄段、性别患者症状有差异，有相关病史家族史人群风险高且症状具特殊性。
腹痛：多为隐痛或绞痛，部位多在左下腹或下腹。疼痛程度和性质因人而异，一般在排便前疼痛较为明显，排便后可有所缓解。例如克罗恩病患者的腹痛常位于右下腹或脐周，呈间歇性发作，疼痛性质多样，可为痉挛性阵痛等。其发生机制主要是炎症刺激肠道神经末梢，引起肠道平滑肌痉挛或肠道蠕动异常。
黏液便或脓血便：肠道黏膜在炎症作用下，会出现充血、水肿、糜烂等病变，导致黏液分泌增加，同时可能有出血现象，从而使粪便中出现黏液或脓血。例如溃疡性结肠炎患者的粪便多为黏液脓血便，这是由于结肠黏膜的慢性炎症及溃疡形成，导致黏膜糜烂出血，与黏液混合排出体外。
全身症状
发热：病情活动期可能出现发热，多为低至中度发热，体温一般在37.5-38.5℃之间，少数患者可出现高热。这是因为炎症反应导致机体的免疫激活，释放炎性介质，引起体温调节中枢功能紊乱。例如克罗恩病患者在肠道炎症活动时，可出现发热症状，且发热可能与肠道病变的活动程度相关。
乏力、消瘦：由于肠道炎症导致营养吸收障碍，患者常出现乏力、消瘦等表现。长期慢性炎症消耗机体能量，影响蛋白质、维生素等营养物质的吸收利用，使得患者体质下降，体重减轻。例如慢性结肠炎患者若病情迁延不愈，可能会逐渐出现乏力、消瘦的情况，影响日常生活和工作。
其他系统症状
关节症状：部分结肠炎患者可出现关节疼痛、肿胀等症状，以外周关节为主，如膝关节、踝关节等。这可能与肠道炎症引起的自身免疫反应有关，肠道炎症产生的某些抗原物质可能与关节组织发生交叉免疫反应，导致关节病变。例如溃疡性结肠炎患者约10%-20%可出现外周关节炎。
皮肤表现：有些患者可能出现皮肤病变，如结节性红斑、坏疽性脓皮病等。结节性红斑表现为双下肢伸侧的红色疼痛性结节，坏疽性脓皮病则表现为皮肤的溃疡性病变。这也是肠道炎症引发的免疫异常在皮肤的表现，与机体的免疫调节紊乱有关。
眼部表现：少数患者可出现眼部症状，如葡萄膜炎、巩膜炎等。同样是由于免疫因素导致眼部组织受到累及，与肠道炎症的免疫相关性类似。
不同年龄段、性别的结肠炎患者症状可能有一定差异。儿童结肠炎患者可能除了上述消化系统等症状外，还可能出现生长发育迟缓的情况，因为肠道炎症影响了营养的吸收，进而影响儿童的正常生长。女性患者在月经周期等生理因素影响下，症状可能会有一定波动。有既往肠道感染病史、自身免疫性疾病家族史等的人群患结肠炎的风险较高，且症状表现可能更具特殊性，需要更加仔细地进行鉴别诊断和治疗。
