新生儿肌张力高与多种因素相关，中枢神经系统相关因素有早产（胎龄小于32周早产儿易因神经髓鞘化不完全致肌张力高）、缺氧缺血性脑病（约30%-40%患儿有肌张力异常增高）、颅内出血（出血累及基底节区等易致肌张力高）；遗传代谢性疾病有先天性甲状腺功能减退症（甲状腺激素不足致中枢神经兴奋性改变、肌张力高）、苯丙酮尿症（苯丙氨酸蓄积影响神经功能致肌张力异常）；感染因素有中枢神经系统感染（病原体侵犯致炎症反应、肌张力高）；其他因素有产伤（分娩中头部受挤压等产伤致脑实质或神经传导束受损、肌张力高）及环境因素（虽影响小但不适环境可致肌张力短时间波动）。
缺氧缺血性脑病：胎儿在宫内窘迫、分娩过程中窒息等情况都可能导致新生儿缺氧缺血性脑病。缺氧会使脑的能量代谢紊乱，神经细胞受损，影响锥体系和锥体外系的功能，进而引起肌张力增高。例如，有研究显示，约30%-40%的缺氧缺血性脑病新生儿会出现不同程度的肌张力异常增高表现。
颅内出血：新生儿颅内出血，如脑室周围-脑室内出血等，血液积聚会压迫脑组织，影响神经传导通路，导致肌张力改变。出血部位不同，对肌张力的影响机制也有所差异，若出血累及基底节区等与肌张力调节密切相关的区域，更容易引起肌张力高。
遗传代谢性疾病
先天性甲状腺功能减退症：甲状腺激素对神经系统的发育和功能维持至关重要。患儿甲状腺激素分泌不足，会影响神经细胞的生长、分化和髓鞘形成，导致中枢神经系统兴奋性改变，出现肌张力增高，同时还常伴有生长发育迟缓、反应迟钝等表现。临床检测甲状腺功能可发现促甲状腺激素升高，甲状腺素降低。
苯丙酮尿症：这是一种常见的氨基酸代谢障碍性疾病，由于苯丙氨酸羟化酶缺乏，苯丙氨酸及其代谢产物在体内蓄积，影响神经系统的正常功能。患儿可出现肌张力异常，早期可能表现为肌张力增高，随着病情进展还会出现智力发育落后、癫痫发作等其他症状。通过新生儿筛查可以早期发现苯丙酮尿症，一旦确诊需限制苯丙氨酸摄入。
感染因素
中枢神经系统感染：如新生儿化脓性脑膜炎等，细菌等病原体侵犯中枢神经系统，引起脑膜和脑实质的炎症反应。炎症刺激会导致神经细胞功能紊乱，影响肌肉的张力调节，出现肌张力高的症状。同时患儿还可能伴有发热、拒奶、嗜睡、抽搐等表现，脑脊液检查可发现白细胞增多、蛋白升高等感染指标异常。
其他因素
产伤：在分娩过程中，如胎儿头部受到过度挤压等产伤情况，可能导致脑实质损伤或神经传导束受损，从而引起肌张力增高。例如，使用产钳助产时操作不当可能会对新生儿头部造成机械性损伤，影响神经系统功能。
环境因素：新生儿出生后所处的环境温度、湿度等不适宜也可能对肌张力产生一定影响，但一般这种影响相对较小。不过，过冷或过热的环境可能会刺激新生儿，引起肌肉的应激性改变，导致肌张力在短时间内出现波动。但长期来看，主要的影响因素还是疾病等病理因素。
