胃食管反流的发生与抗反流屏障结构与功能异常、食管清除作用降低、食管黏膜防御机制减弱、胃排空延迟等因素有关，如LES压力降低、结构异常、老年人及神经系统疾病等致食管清除作用降、吸烟饮酒等致食管黏膜屏障功能降、全身病影响及老年人、疾病、药物等致胃排空延迟等均易引发胃食管反流。
一、抗反流屏障结构与功能异常
（一）食管下括约肌（LES）压力降低
LES是食管末端约3-4cm长的环形肌束，是阻止胃内容物反流的重要结构。正常情况下，静息时LES压力为10-30mmHg，能防止胃内容物反流。当某些因素导致LES压力降低时，如肥胖患者腹腔内脂肪堆积过多，腹腔压力升高，可传导至LES使其压力降低；老年人LES结构和功能发生生理性退变，也会出现LES压力降低；一些药物如钙通道阻滞剂、硝酸甘油等，可引起LES压力降低，从而增加胃食管反流的风险。
（二）LES相关结构异常
食管裂孔疝是引起LES结构异常的常见原因。食管裂孔疝是指部分胃组织通过膈食管裂孔进入胸腔，这会破坏LES的正常解剖结构，导致LES抗反流屏障功能减弱。妊娠期间，增大的子宫可压迫腹腔，使腹内压升高，同时激素变化可能影响LES功能，也易引发胃食管反流；对于有先天性食管裂孔发育异常的人群，成年后也可能因各种因素诱发食管裂孔疝，进而导致胃食管反流。
二、食管清除作用降低
正常情况下，食管通过蠕动和唾液的清除作用来清除反流的胃内容物。老年人食管蠕动功能减退，会使食管对反流物的清除能力下降；一些神经系统疾病患者，如帕金森病患者，食管蠕动功能可能受到影响，导致食管清除作用降低，使得反流物在食管内停留时间延长，对食管黏膜的刺激增加，容易引发胃食管反流。另外，唾液分泌减少也会影响食管的清除作用，例如某些药物副作用可能导致唾液分泌减少，进而增加胃食管反流的发生几率。
三、食管黏膜防御机制减弱
（一）食管黏膜屏障功能下降
食管黏膜表面的黏液层、碳酸氢盐分泌、上皮细胞层等构成了食管黏膜屏障，能抵御反流物的损伤。长期吸烟、饮酒的人群，烟草中的尼古丁和酒精会损伤食管黏膜屏障，使黏膜对反流物的抵御能力下降；一些患有食管炎症性疾病的患者，如反流性食管炎患者，其食管黏膜屏障功能本身就存在异常，更容易发生胃食管反流，且反流又会进一步加重食管黏膜的损伤，形成恶性循环。
（二）全身因素影响
某些全身性疾病也会影响食管黏膜防御机制。例如，糖尿病患者可能存在自主神经病变，影响食管的正常生理功能，包括黏膜的防御功能；营养不良的人群，由于缺乏必要的营养物质来维持食管黏膜的正常结构和功能，也会使食管黏膜防御机制减弱，增加胃食管反流的易感性。
四、胃排空延迟
胃排空延迟会使胃内食物潴留，胃内压力升高，当胃内压力超过LES压力时，就容易导致胃内容物反流。老年人胃动力本身就相对较弱，胃排空速度较慢；一些胃肠道疾病患者，如幽门梗阻患者，胃排空明显延迟；此外，某些药物也可能影响胃排空，如抗胆碱能药物等，这些因素都可能引发胃食管反流。对于患有胃轻瘫综合征的患者，胃排空延迟更为显著，更容易出现胃食管反流的症状。
